[发明专利]一种全连接CRF级联FCN和K均值脑肿瘤分割算法有效
申请号: | 201910632303.8 | 申请日: | 2019-07-13 |
公开(公告)号: | CN110349170B | 公开(公告)日: | 2022-07-08 |
发明(设计)人: | 侯阿临;杨理柱;刘丽伟;李阳;李秀华;梁超;杨冬;姜伟楠;季鸿坤 | 申请(专利权)人: | 长春工业大学 |
主分类号: | G06T7/12 | 分类号: | G06T7/12;G06T7/13;G06V10/762;G06V10/82;G06K9/62 |
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地址: | 130012 吉*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 连接 crf 级联 fcn 均值 肿瘤 分割 算法 | ||
1.一种全连接CRF级联FCN和K均值脑肿瘤分割算法,其特征在于,包括以下步骤:
Step 1:建立级联型FCN脑肿瘤分割模型,用该模型对测试图像进行分割,获取FCN脑肿瘤图像分割结果,并对级联型FCN的每一级分割结果搜寻边缘框,并将边缘框作为下一级FCN和K均值聚类算法的边界限定框;
Step 2:对每一级FCN的分割结果进行全连接CRF后处理操作;
Step 3:使用K均值聚类算法对每一级FCN的输入图像在边界框内的部分进行分割处理,获取K均值聚类算法脑肿瘤图像分割结果;
Step 4:将每一级的FCN分割结果和K均值聚类算法的分割结果进行融合,获取脑肿瘤图像的最终分割结果;
所述Step 1中的具体过程如下:
Step 1.1:使用三个FCN来分级和顺序地分割脑肿瘤的子结构,三个网络顺序定义为WNet、TNet、ENet,每一级网络都处理二元分割问题;
Step 1.1.1:选择搭建通用的FCN;
Step 1.1.2:WNet和TNet使用20个片内卷积层和4个带有两个2D下采样层的片间卷积层,ENet使用与第一个网络相同的卷积层组,但考虑到其较小的输入大小,仅使用一个下采样层;
Step 1.1.3:把FCN的每两个卷积层作为一个模块,加入残差模块,将每个模块的输入连接到输出,使模块参考输入来学习残差函数,使信息传播平稳并加速训练的收敛;
Step 1.1.4:在每一个残差模块加入扩张卷积,用于片内核以扩大切片内的感受野;
Step 1.2:训练级联型FCN脑肿瘤分割模型,脑肿瘤训练集来自BraTS公开挑战赛,训练时,TNet和ENet的边界框来自手动分割的真实结果;
Step 1.3:利用级联型FCN脑肿瘤分割模型对测试集图像进行分割;
Step 1.3.1:用训练好的级联型FCN分割模型分级顺序分割脑肿瘤的整个肿瘤,肿瘤核心以及增强型肿瘤核心三个部分;
Step 1.3.2:每一级FCN分割模型分割完成后,对分割结果提取边界框作为下一级要分割的图的边界框;
所述Step 2中的具体过程如下:
Step 2.1:搭建全连接CRF后处理循环网络;
Step 2.1.1:将FCN的softmax层的概率分布输出作为全连接CRF的一元势函数ψu(xi)输入,将原图像作为全连接CRF的二元势函数ψp(xi,xy)输入;其中二元势函数由以下公式得到:
Step 2.1.2:使用所有高斯滤波器分别对每一个类别的概率分布E(X)进行滤波;其中E(X)由以下公式得到:
Step 2.1.3:对每一个类别的所有滤波结果根据权重相加;
Step 2.1.4:对每一个类别的概率分布根据不同类别之间的兼容性矩阵进行更新;
Step 2.1.5:加上一元势函数;
Step 2.1.6:对各像素所不同类别I的概率归一化;
Step 2.1.7:将归一化后的结果作为softmax层的概率分布输出的替换,重复步骤2.1.2-2.1.6,直到概率不再改变。
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