[发明专利]诊断CVM的基因突变及其应用

说明书

本发明公开了一种CVM相关的基因突变。本发明通过二代测序技术首次发现了CVM患者基因组DNA上存在MYH3基因c.841GA突变。根据上述研究成果，本发明开发了一种诊断CVM的产品，该产品通过检测受试者基因组DNA上MYH3基因c.841位点的基因型即可判断受试者是否患有CVM，该产品可应用于临床。

技术领域

本发明属于医学诊断领域，涉及一种诊断CVM的基因突变。

背景技术

先天性脊柱畸形(Congenital Vertebral Malformations，CVM)代表一组严重的先天性缺陷，临床可表现为先天性脊柱侧凸(CS)，脊柱后凸，Klippel Feil综合征和其他复杂综合征。脊柱畸形分为三种类型，包括形成障碍(半椎体、蝴蝶椎和楔形椎)，分节不良(椎体融合，阻滞椎和未分节椎体)和混合畸形。CVM患病率约为1/2000。其他器官或系统畸形，如中枢神经缺陷，胃肠道缺陷，泌尿生殖系统缺陷和心血管系统缺陷，也可发生在CVM患者身上。CVM是胚胎发育过程中轴旁中胚层发育异常的结果。据报道，几个基因(TBX6、NOTCH2、DLL39)与CVM有关。申请人之前已经证明TBX6遗传模型可以解释大约10％的CS病例，这些患者具有独特的临床特征，因此定义了新的CS表型(TBX6相关的先天性脊柱侧凸，TACS)。然而，仍有大量CVM患者的病因不明确。

胚胎肌球蛋白重链基因(Embryonic myosin heavy chain，MYH3)编码胚胎肌球蛋白的重链。它主要在孕周6至24周表达，在妊娠37周时完全被消除。已知，MYH3是远端关节挛缩综合征(distal arthrogryposis syndrome,DA)的致病基因，远端关节挛缩综合征包括DA1(OMIM：108120)，DA2A(Freeman-Sheldon综合征，OMIM：193700)和DA2B(Sheldon-Hall综合征，OMIM：601680)。最近，MYH3也显示与常染色体显性multiple pterygium综合征(DA8，OMIM：178110)和呈显性或隐性模式的Spondylocarpotarsal synostosis综合征(SCT，OMIM：272460)相关。脊柱畸形是DA8和SCT最常见的临床特征之一。

在本申请中，申请人研究了具有致病性MYH3变体的CVM患者的基因型和表型特征以及候选MYH3变体的致病性。

发明内容

本发明的目的在于提供一种能够在CVM早期即可准确诊断疾病发生与否的诊断标志物及其应用。

根据本发明的一个方面，本发明提供了一种用于诊断CVM的基因突变，所述基因突变是MYH3基因上的突变。

进一步，所述突变位点是MYH3基因c.841位。即可以通过检测MYH3基因c.841位点的基因型来诊断CVM。

具体的，所述突变是c.841GA。

根据本发明的又一个方面，本发明还提供了检测前面所述的基因突变位点基因型的试剂。

进一步，所述试剂包括针对前面所述的基因突变位点的特异性扩增引物。

进一步，所述试剂还包括dNTPs、Taq酶、Mg²⁺和PCR反应缓冲液等PCR扩增反应中常规试剂。

本发明提供了前面所述的基因突变位点在制备前面所述的试剂中的应用。本领域技术人员根据基因突变位点上下游序列设计特异性扩增引物或者特异性检测探针。引物和探针的设计方法是本领域的常规技术。

本发明还提供了前面所述的基因突变位点在制备前面所述的试剂中的应用。

本发明还提供了前面所述的基因突变位点在制备CVM诊断产品中的应用。

本发明还提供了前面所述的试剂在制备CVM诊断产品中的应用。