[发明专利]一种鉴定甜瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合

说明书

本发明属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定甜瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合。鉴定甜瓜品种真实性的SSR位点，选自如下第一SSR位点到第二十三SSR位点中的任1到23种；上述SSR引物组合选自：第一SSR引物对至第二十三SSR引物对，分别用于PCR扩增上述第一SSR位点至第二十三SSR位点，分别优选为与序列表中的SEQ ID NO：1‑46的核苷酸序列的同源性为85％‑100％的核苷酸序列。本发明可用于对甜瓜品种在种子或幼苗期进行早期鉴定，保证品种的真实性，切实保护生产者和育种家的权益，并为甜瓜种质资源和新品种保护提供技术支持。

技术领域

本发明属于分子标记及其检测领域，具体涉及一种鉴定甜瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合。

背景技术

甜瓜是我国重要的蔬菜作物，栽培面积已达139.6万公顷，占全国蔬菜栽培面积的6.2％。改革开放以来随着甜瓜产业的快速发展，通过国家和各省审定的品种逐年增多。依据《非主要农作物品种登记办法》，2017年4月农业部公布了第一批非主要农作物品种登记目录，甜瓜位列其中。截止到2019年4月，甜瓜登记品种数量仅在两年内已达到826份。这种“井喷式”爆发现象为开展登记品种管理和市场监管，特别是依赖田间鉴定的方式提出了前所未有的挑战。由于甜瓜育种企业较小且分散，各省市之间品种审定相互不协调，甜瓜的品种管理未能有效跟进，存在很多假冒伪劣品种，其中很多为衍生、派生近似品种。加之良种生产基地管理混乱，盗育、套购品种现象猖獗，同名异种现象严重，种子质量事故时有发生。根据《非主要农作物品种登记指南》的要求，品种特性说明和品种DUS测试报告中涉及的有关性状如有明确关联基因，可以直接提交DNA检测结果。因此，我国急需建立与当前甜瓜品种管理需求相匹配的DNA快速检测技术。

近年来，SSR分子标记以其数量多、变异丰富、遗传稳定等优点广泛应用在品种真实性鉴定方面。目前，我国甜瓜品种鉴定的DNA分子检测主要依据SSR分子标记。但是，当时的SSR引物研发没有参考甜瓜基因组变异组大数据支撑，对扩增片段及SSR Motif内部的序列真实变异情况没有掌握，存在不真实变异情况；SSR引物筛选所用的品种数量较少，且不能代表我国当前市场的销售品种。因此现行标准容易造成扩增不成功，真实性、稳定性不佳等问题，进而造成分子鉴定判定结果假阳性、假阴性。

因此，在利用SSR分子标记鉴定甜瓜品种的工作中，需要一种基于大规模甜瓜重测序和分析甜瓜变异组信息的、稳定高效的SSR位点和测定方法。

发明内容

本发明提供了一种鉴定甜瓜品种真实性的方法及其专用SSR引物组合，可以得出稳定、高效的鉴定结果：待测甜瓜品种是否属于标准甜瓜品种中的某一种，以及具体是哪一种。

本发明是通过以下的技术方案实现的：