[发明专利]与盐胁迫条件下小麦粒重相关的KASP标记及其应用

说明书

本发明公开了一种与盐胁迫条件下小麦粒重相关的KASP标记及其应用。本发明提供了检测SNP标记AX‑109277923的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦粒重中的应用；所述SNP标记AX‑109277923为位于小麦2D染色体上的第569361770位核苷酸，其为C或G。本发明基于QTL定位获得与盐胁迫条件下小麦粒重相关的SNP标记AX‑109277923。进一步开发出与SNP标记AX‑109277923相关联的KASP标记，为选育高产稳产品质优良的耐盐小麦品种奠定理论基础且提供分子辅助选择手段。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，具体涉及与盐胁迫条件下小麦粒重相关的KASP标记及其应用。

背景技术

小麦是世界上最重要的粮食作物之一，也是中国北方人民最重要的主食。有研究指出，预计到2050年世界人口将超过90亿，小麦总产量需要增加70％才能满足未来的需求，科学家、育种家和农民都面临着巨大的挑战。中国盐渍化土壤分布广泛，面积达14.87亿亩，约合1亿公顷。培育耐盐小麦新品种，有效利用盐碱地等中低产田，是提高粮食总产量的有效途径。小麦产量由亩穗数、穗粒数和千粒重三个因素决定。千粒重较另外两个产量要素受环境影响较小，并主要受加性效应基因控制，遗传力高达59％-80％。研究表明，千粒重是现代育种中遗传改进最为显著的产量性状。因此，定位和克隆盐胁迫条件下与小麦千粒重稳定相关的基因或QTL对小麦总产量的提高具有重要意义。综合以前连锁分析和关联分析的结果发现，小麦21条染色体上均检测到千粒重相关的QTL，且主效位点定位在2A、2D、4A、5A、6A和7D染色体上。然而，在盐胁迫条件下与小麦千粒重稳定相关的QTL却鲜有报道。

分子标记辅助选择育种技术可以通过选择与目标性状紧密连锁的分子标记，达到选择目标性状的目的。它简单快速且不受环境影响，对小麦千粒重等性状的选择可以在植株生长早期甚至种子状态时实现，节省了大量人力物力。

单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphisms，SNP)是指在基因组水平上由单个核苷酸的变异所引起的DNA序列多态性。SNP可以稳定遗传，并且分布广泛，多态性丰富，易于实现自动化分析。目前SNP检测的方法主要有两种：简化基因组测序和SNP芯片。但是当通过连锁分析或关联分析获得与目标性状连锁的SNP标记后，检测其他材料是否含有该优良位点时，简化基因组测序或高密度SNP芯片技术成本显然太高，且没有必要。竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR，KASP)技术可以基于引物末端碱基的特异匹配实现SNP分型及插入、缺失的检测(Insertions and Deletions，InDels)。与Taqman探针相比，KASP方法可以通过通用荧光探针来替代针对位点的荧光探针，大大节约成本。

因此，筛选出与盐胁迫环境下千粒重相关的标记，并利用该标记筛选粒重性状优良的小麦品种，为选育高产稳产品质优良的耐盐小麦品种奠定理论基础且提供分子辅助选择手段。

发明内容

本发明所要解决的技术问题为如何开发与小麦粒重相关的KASP标记，尤其是盐胁迫条件下小麦粒重相关的KASP标记，以选育出高产的耐盐小麦品种。

为解决上述问题，本发明提供了检测SNP标记AX-109277923的多态性或基因型的物质在鉴定或辅助鉴定小麦粒重中的应用；

所述SNP标记AX-109277923为位于小麦2D染色体上的第569361770位核苷酸，其为C或G。

上述应用中，所述鉴定或辅助鉴定小麦粒重中的应用为鉴定或辅助鉴定盐胁迫条件下小麦粒重中的应用。

上述检测SNP标记AX-109277923的多态性或基因型的物质在小麦育种尤其是耐盐小麦育种中的应用也在本发明的保护范围之内。

上述应用中，所述小麦育种为培育高粒重的耐盐小麦品种。