[发明专利]一种黄芪抗辐射损伤相关基因筛选与功能分析方法

权利要求书

1.一种黄芪抗辐射损伤相关基因筛选与功能分析方法，其特征在于，所述的方法包括如下步骤：

(1)筛选活性成分：在数据库中收集黄芪的化学成分，依据数据库对活性成分的ADME评估值，筛选活性成分；黄芪活性成分17个；

(2)基因靶点获得：通过数据库获得上述活性成分的化学结构，将这些化学结构提交到DRAR-CPI服务器，获得相关化学成分的作用靶点，通过UniProt数据库将这些作用靶点校正为其官方名称，经检索和转化获得与活性成分相关的基因靶点；

(3)在GeneCards数据库中检索得到与辐射损伤相关的靶点；

(4)获得潜在抗辐射损伤靶点：将步骤(2)和步骤(3)获得的靶点取交集，获得黄芪活性成分抗辐射作用潜在抗辐射损伤靶点；黄芪活性成分抗辐射作用靶点91个；

(5)构建黄芪活性成分-作用靶点网络，获得蛋白相互作用关系，进行GO分析和KEGG通路分析。

2.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，所述的数据库为TCMSP数据库。

3.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(1)中，依据ADME评估值筛选活性成分时，设置口服生物利用度OB≥30％、类药性DL≥0.18的成分作为黄芪活性成分。

4.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(2)中，获得化学结构的数据库为Pubchem数据库。

5.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(2)中，将黄芪活性成分的化学结构提交到DRAR-CPI服务器，选取Z-score-0.5的作用靶点作为相关化学成分的作用靶点。

6.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(3)中，通过关键词“irradiationdamage”、“irradiation protection”、“radiation damage”、“radiation protection”检索得到与辐射损伤相关的靶点。

7.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(5)中，将筛选出的黄芪活性成分、抗辐射损伤的作用靶点导入cytoscape3.4.0软件来构建黄芪活性成分-作用靶点网络。

8.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(5)中，将筛选得到的黄芪活性成分潜在抗辐射损伤的作用靶点上传至string数据库，获得蛋白相互作用关系。

9.根据权利要求1所述的方法，其特征在于：步骤(5)中，在DAVID数据库中上传黄芪活性成分潜在抗辐射损伤作用靶点，限定物种为人，进行GO分析和KEGG通路分析。

10.根据权利要求9所述的方法，其特征在于：步骤(5)中，在DAVID数据库中上传黄芪活性成分潜在抗辐射损伤作用靶点，选取P＜0.05的过程/通路，并根据靶点数目，即Count值的大小筛选出相关度高的功能/通路。