[发明专利]翘嘴鲌抑制素βB基因SNP位点的筛选方法及其应用

说明书

本发明涉及分子生物学技术领域，尤其是翘嘴鲌抑制素β_B基因SNP位点筛选方法及其应用，用于翘嘴鲌生长性状分析，尤其是抑制素βB基因的c.717G>T、c.778G>A位点用于对翘嘴鲌体长、体重、体厚、体高、全长、尾柄长、尾柄高的分析。为翘嘴鲌的分子标记辅助育种提供重要参考。

技术领域

本发明涉及分子生物学技术领域，尤其是翘嘴鲌抑制素β_B基因SNP位点筛选方法及其应用。

背景技术

翘嘴鲌(Culter alburnus) 俗名白鱼，隶属于鲤科、鲌亚科、鲌属，其适应性较强，广泛分布于我国长江中下游地区各水域。翘嘴鲌经济价值高，是有名的 “太湖三白”之一（张小谷等，2005）。通过对遗传背景一致的全同胞翘嘴鲌苗种同塘养殖实验发现性成熟时雌鱼体重高于雄鱼15%以上，养殖全雌翘嘴鲌具有较好的市场前景。考虑到雌核发育为母系遗传，能够快速保持母本优良性状，是快速育种繁殖的有效手段（钟源等，2009；杜民等，2013；Komen et al，2007），作者所在团队多年来以优质的雌核发育后性成熟翘嘴鲌为母本，以性逆转并成熟的雌核发育翘嘴鲌伪雄鱼为父本进行配对来生产全雌翘嘴鲌。在此生产过程中发现雌核发育1代个体大小差异明显，是作为筛选生长相关分子标记的良好素材。

抑制素(inhibin，INH)是一种二聚体糖蛋白激素，主要由雄性睾丸支持细胞和雌性卵巢颗粒细胞分泌（张超等，2011）。抑制素由α亚基和不同的β亚基通过二硫键连接而成，其中β亚基有两种类型(βA 和βB)。α亚基和βB亚基构成的抑制素称为抑制素B。抑制素属于转化生长因子β(transforming growth factorβ ，TGFβ)超家族成员，该超家族的多个基因均已证明直接或间接与肌肉生长发育相关（Stinckens 等，2011）。而且抑制素基因在多个组织内分布广泛，通过激素调控、自分泌和旁分泌的方式来参与细胞功能和细胞增殖（Rohayem, 2015）。在人类中都发现抑制素水平与子痫前期胎儿的生长受限有关（Florio，2002）。Vassalli等通过小鼠的活化素/抑制素βB基因突变的研究表明抑制素βB基因在小鼠胚胎发育后期起作用（Vassalli 等， 1994），这些研究表明抑制素基因可能参与到机体的生长发育过程。

单核苷酸多态性（Single nucleotide polymorphism，SNPs）是指在基因组上单个核苷酸的变异（Lander，1996），是继限制性片段长度多态性和简单重复序列后的第三代分子标记。SNP标记的优点包括：突变位点数目多；高度的遗传稳定性；有利于实现高通量检测等优点（季华员等，2010）。

目前，还没有报道抑制素基因SNP位点作为翘嘴鲌生长相关分子标记。

发明内容

本发明公开抑制素βB基因SNP位点用于翘嘴鲌生长性状分析，尤其是用于对翘嘴鲌体长、体重、体厚、体高、全长、尾柄长、尾柄高的分析。

更具体说，是抑制素βB基因的c.717G>T、c.778G>A位点用于对翘嘴鲌体长、体重、体厚、体高、全长、尾柄长、尾柄高的分析。

本发明的目的是提供一种筛选抑制素βB基因SNP位点的方法，以获得与翘嘴鲌体长、体重、体厚、体高、全长、尾柄长、尾柄高相关的位点，为翘嘴鲌的分子标记辅助育种提供重要参考。

本发明采用如下的技术方案：

翘嘴鲌抑制素βB基因SNP位点筛选方法，包括如下步骤：

S-1. 材料的准备；

S-2. 基因组DNA 的提取；