[发明专利]电泳分离数据解析装置及方法、存储介质有效

专利信息
申请号: 201910659595.4 申请日: 2019-07-22
公开(公告)号: CN110794025B 公开(公告)日: 2022-08-19
发明(设计)人: 熊谷英乡;原田亨;荻野康太 申请(专利权)人: 株式会社岛津制作所
主分类号: G01N27/447 分类号: G01N27/447
代理公司: 北京林达刘知识产权代理事务所(普通合伙) 11277 代理人: 刘新宇
地址: 日本*** 国省代码: 暂无信息
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摘要:
搜索关键词: 电泳 分离 数据 解析 装置 方法 存储 介质
【说明书】:

本发明提供一种电泳分离数据解析装置及方法、存储介质。电泳分离数据解析装置具备:解析对象峰确定部,其构成为使用户输入与在通过电泳分离得到的分离数据中添加到解析对象的解析对象峰有关的解析对象峰信息,基于该解析对象峰信息来确定至少一个所述解析对象峰;关注峰确定部,其使用户输入与所述解析对象峰中的关注峰有关的关注峰信息,基于该关注峰信息来确定所述关注峰;以及存在率计算部,其构成为基于所述解析对象峰的峰面积的合计值和所述关注峰的峰面积值来求出所有的所述解析对象峰中的所述关注峰的存在率。

技术领域

本发明涉及一种用于对通过电泳分离获取到的分离数据进行解析的电泳分离数据解析装置、电泳分离数据解析方法以及用于使计算机执行该解析方法的计算机程序。

背景技术

在生物化学领域存在以下情况:基于通过电泳分离得到的分离数据,求出在试样中混在一起的类似分子中的所关注的分子(核酸、蛋白质)的存在率,以在试样的解析中利用(参照专利文献1。)。例如是求出细胞集团中的野生型基因细胞和变异型基因细胞的存在率的情况、在表达解析中比较评价关注基因的表达量相对于对照基因的表达量的情况等情况。

现有技术文献

专利文献

专利文献1:日本特开2005-69846号公报

发明内容

发明要解决的问题

以往,作为求出关注分子的存在率的方法,存在以下的方法:获取通过琼脂糖凝胶电泳、聚丙烯酰胺凝胶电泳使试样分离后的凝胶的数字图像,根据该数字图像中的各分级的亮度来求出各分级的浓度,根据求出的各分级的浓度来计算关注分子的存在率。另外,在近年来的使用了毛细管、微细流路设备的电泳的解析装置中,根据在电泳图中出现的各峰的面积来自动地计算通过电泳分离出的各分级的浓度,因此也能够使用计算出的各分级的浓度通过手算或计算工具来求出所关注的峰(分级)的存在率。

在上述的任一种方法中,都需要通过手算或使用了计算工具的计算来求出所关注的分级的存在率,无法容易且迅速地获取与存在率有关的数据。

因此,本发明的目的在于,能够容易且迅速地获取通过电泳分离出的分级中的所关注的任意的分级的存在率。

用于解决问题的方案

本发明所涉及的电泳分离数据解析装置具备:解析对象峰确定部,其构成为使用户输入与在通过电泳分离得到的分离数据中添加到解析对象的解析对象峰有关的解析对象峰信息,基于该解析对象峰信息来确定至少一个所述解析对象峰;关注峰确定部,其使用户输入与所述解析对象峰中的关注峰有关的关注峰信息,基于该关注峰信息来确定所述关注峰;以及存在率计算部,其构成为基于所述解析对象峰的峰面积的合计值和所述关注峰的峰面积值来求出所有的所述解析对象峰中的所述关注峰的存在率。在此,“峰”相当于通过电泳分离出的每个分级。

即,本发明所涉及的电泳分离数据解析装置构成为:只要用户输入与解析对象峰有关的解析对象峰信息及与关注峰有关的关注峰信息,就会自动地求出解析对象峰中的关注峰的存在率。

在本发明所涉及的电泳分离数据解析装置中,所述存在率计算部优选构成为在确定了所述解析对象峰和所述关注峰时立即计算所述关注峰的存在率。于是,只要用户输入与解析对象峰有关的解析对象峰信息及与关注峰有关的关注峰信息,就会立即求出关注峰的存在率,因此用户能够迅速地得到关注峰的存在率。

本发明所涉及的电泳分离数据解析装置优选还具备存在率显示部,该存在率显示部将由所述存在率计算部计算出的所述关注峰的存在率显示于显示装置。于是,用户能够容易地识别关注峰的存在率。

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