[发明专利]一种KRAS基因突变位点的检测引物、探针和试剂盒在审
申请号: | 201910671699.7 | 申请日: | 2019-07-24 |
公开(公告)号: | CN110373453A | 公开(公告)日: | 2019-10-25 |
发明(设计)人: | 曹曼曼;秦闯华;徐根明;潘艺;赵谦 | 申请(专利权)人: | 湖南大地同年生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6858 | 分类号: | C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 深圳智趣知识产权代理事务所(普通合伙) 44486 | 代理人: | 邵萌 |
地址: | 410205 湖南省长沙*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 试剂盒 突变点 突变 检测引物 突变位点 反应管 探针 突变位点检测 临床实际 突变检测 血液样本 样本类型 引物设计 样本DNA 灵敏性 密码子 抑制剂 检出 位点 粪便 耗时 样本 应用 | ||
1.一种能够同时检测7种KRAS基因突变的引物和探针组合物,所述KRAS基因突变包括在2号外显子第12和第13位的如下密码子突变点中的任一种或多种:G12S、G12R、G12C、G12D、G12A、G12V、G13D;所述引物是将所述突变点设计在引物序列3'端的第一位,并在3'端的第二位、第三位和/或第四位增加一个或多个碱基的错配,使野生型的序列不能与设计的引物序列结合,而突变型的序列能高效的扩增;优选地,所述的密码子突变对应的碱基突变依次为34G>A、34G>C、34G>T、35G>A、35G>C、35G>T、38G>A。
2.根据权利要求1所述的引物和探针组合物,所述的引物包括如下任一种或多种:
针对KRAS基因突变点G12S检测设计的上游引物序列如SEQ ID NO.1所示;
针对KRAS基因突变点G12R检测设计的上游引物序列如SEQ ID NO.2所示;
针对KRAS基因突变点G12C检测设计的上游引物序列如SEQ ID NO.3所示;
针对KRAS基因突变点G12S、G12R、G12C检测设计的下游引物序列如SEQ ID NO.4所示;
针对KRAS基因突变点G12D、G12A、G12V、G13D检测设计的上游引物序列如SEQ ID NO.5所示;
针对KRAS基因突变点G12D检测设计的下游引物序列如SEQ ID NO.6所示;
针对KRAS基因突变点G12A检测设计的下游引物序列如SEQ ID NO.7所示;
针对KRAS基因突变点G12V检测设计的下游引物序列如SEQ ID NO.8所示;
针对KRAS基因突变点G13D检测设计的下游引物序列如SEQ ID NO.9所示;
所述探针包括如下任一种或多种:
针对KRAS基因突变点G12S、G12R、G12C检测设计的探针序列如SEQ ID NO.10所示;
针对KRAS基因突变点G12D、G12A、G12V、G13D检测设计的探针序列如SEQ ID NO.11所示。
3.根据权利要求1或2所述的引物和探针组合物,所述引物和探针组合物还包括内参基因GAPDH的上、下游引物和探针,所述GAPDH的上游引物序列如SEQ ID NO.12所示,所述GAPDH的下游引物序列如SEQ ID NO.13所示,所述GAPDH的探针序列如SEQ ID NO.14所示。
4.权利要求1-3任一项所述的引物和探针组合物在制备检测KRAS基因突变的试剂盒中的应用,所述KRAS基因突变为肿瘤样本的KRAS基因突变,所述肿瘤包括肺癌、结直肠癌,所述样本包括粪便样本、人类的全血样本、血浆样本、组织样本、口腔样本、尿液样本、唾液样本、FFPE样本;作为优选地,所述肿瘤为结直肠癌;作为优选地,所述样本为粪便样本。
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