[发明专利]抗稻瘟病基因Pi67(t)的显性分子标记及其应用

说明书

本发明属于农作物分子遗传育种学领域，具体涉及一种水稻抗稻瘟病基因Pi67(t)的显性分子标记及其应用。分子标记为在水稻抗稻瘟基因Pi67(t)的定位区域内存在一个141bp的插入，核苷酸序列如SEQID NO.1所示。本发明通过检测该分子标记，可以准确判断待测水稻样品中是否携带抗稻瘟病基因Pi67(t)，加快抗稻瘟病水稻品种选育进程。

技术领域

本发明属于农作物分子遗传育种学领域，具体涉及一种水稻抗稻瘟病基因Pi67(t)的显性分子标记及其应用。

背景技术

稻瘟病(Pyricularia grisea cav.)是由稻瘟病菌(Magnaporthe oryzae；无性态：Pyricularia)引起的水稻病害，其分布范围十分广泛。据统计，全世界有80余个国家均有发生，一般流行年份可造成10％-20％的减产，严重发生时则达到40％-50％。20世纪90年代以来，我国稻瘟病的年发生面积均在380万hm2以上，每年损失稻谷达数亿千克。随着品种应用的单一化、集中化以及气候的影响，稻瘟病的危害也越来越重。尽管人们在病害防治上耗费了巨大的精力和物质投入，但限于诸多方面因素的影响，防病效果一直不尽人意，尤其在病害严重发生年份，常常给生产、育种造成重大损失。以辽宁省为例，自20世纪90年代起，分别发生了因辽粳287、辽盐241、辽粳454和辽星1号几个主栽品种抗病性退化导致的穗颈瘟大面积发生，严重影响了北方粳稻的生产。产生这种现象的根本原因就是主栽品种对稻瘟病菌的抗谱狭窄，且单一化、集中化种植现象普遍，这样一旦稻瘟菌流行小种发生变化，品种对稻瘟病的抗性便迅速下降。因此，选育聚合多基因或具广谱抗性的水稻品种尤为必要。

目前，在抗稻瘟病品种选育的过程中，育种家主要采用系谱法，或结合分子标记辅助选择抗病个体。传统的系谱法通过两亲本组配，从分离后代中择优选育品种，抗瘟表型依赖于田间自然鉴定或人工接种鉴定，鉴别难度大，准确率低。由于不了解亲本的抗瘟基因型，育种者在亲本选择上非常盲目，通常是海量配组，海量选择后代，工作量大，育种效率低。在利用分子标记辅助选择进行抗病育种时，所选用的多是与抗病基因连锁的SSR标记，易造成假阳性的判断，如能根据抗感等位基因本身的序列差异来设计不同基因的共分离标记，不仅可首先检测亲本所携带的抗瘟基因，也能在后代辅助选择时大大提高抗性品种选择的准确性。

发明内容

本发明的目的是提供一种水稻抗稻瘟病基因Pi67(t)的显性分子标记及其应用。

为实现上述目的，本发明采用技术方案为：

一种抗稻瘟病基因Pi67(t)，在水稻品种GY8的第12号染色体10.18Mb-11.19Mb区域内，存在抗稻瘟病基因Pi67(t)。

一种与所述的抗稻瘟病基因Pi67(t)的显性分子标记：分子标记为在水稻抗稻瘟病Pi67(t)的定位区域内存在一个141bp的插入位点，核苷酸序列如SEQID NO.1所示。

一种用于检测所述分子标记的的引物组合，所述引物组合由如SEQ ID NO.2和SEQID NO.3中碱基序列所示；其中，SEQ ID NO.2正向引物Pi67(t)-1-F序列是5′-TAACTTGTCAACGCATCACC-3′，SEQ ID NO.3反向引物Pi67(t)-1-R序列是5′-AATTAAAGTTCTCATTCGACCA-3′。

一种所述的引物组合的应用，所述引物组合在选育携带抗稻瘟病基因Pi67(t)的水稻品种中的应用。

进一步的说：

1)以携带抗稻瘟病基因Pi67(t)的水稻抗病品系GY8与其它不携带抗稻瘟病基因Pi67(t)的水稻品种杂交并繁衍后代群体；

2)提取上述所获得群体中单个植株的基因组DNA，用权利要求3所述引物组合进行PCR扩增，扩增产物的片段长度为1284bp，则标志着所检测水稻样品携带抗稻瘟病基因Pi67(t)。