[发明专利]一种前列腺癌患者预后复发风险预测标志工具及其风险评估模型的建立

说明书

本发明提供一种前列腺癌患者预后复发风险预测标志工具及其风险评估模型的建立，涉及癌症预后风险评估技术领域。所述标志工具为8个MiRNA标志物，分别为hsa‑mir‑10a、hsa‑mir‑10b、hsa‑mir‑206、hsa‑mir‑21、hsa‑mir‑221、hsa‑mir‑222、hsa‑mir‑30e、hsa‑mir‑340，并根据标志物进行预测模型的构建。本发明克服了现有技术的不足，提出8个MiRNA标志物作为前列腺癌患者预后复发风险预测的标志工具，提高预测准确性，同时建立风险评估模型，有效评测不同患者预后的风险，提升检测效率，适宜推广使用。

技术领域

本发明涉及前列腺癌预后风险评估技术领域，具体涉及一种前列腺癌患者预后复发风险预测标志工具及其风险评估模型的建立。

背景技术

前列腺癌(PCa)给全世界男性带来了沉重的健康负担，导致 350,000以上患者死亡，2018年在癌症原因死亡中前列腺癌排第五位。大约5％的前列腺癌患者在明确诊断时发现为晚期或已发生转移。初始激素治疗通过抑制睾酮和雄激素受体(AR)信号通路，可以抑制大多数晚期前列腺癌患者的疾病进展；然而，这些患者易发展为去势抵抗性前列腺癌(CRPC)，并且这些患者中大约10-20％在诊断后的五年内发展为CRPC。75岁以上的患者中，48％的患者在诊断同时已发生转移，前列腺癌特异性死亡率也高达53％。

微小RNA(miRNA)是一类长度为17-25bp的非编码RNA，其可通过与mRNA的3'非翻译区(3'-UTR)结合而在转录后水平影响编码蛋白质的基因。miRNA通过该机制调节约一半的mRNA表达。大量文章已报道，miRNA可以参与细胞分化，凋亡，增殖和细胞周期阻滞等正常生理过程。此外，miRNA还参与各种癌症的发生过程，如胰腺癌，结肠直肠癌，食道鳞状细胞癌，卵巢癌，脑胶质瘤，宫颈癌和前列腺癌等。随着基因测序在肿瘤中的应用，miRNA被认为是预测预后和耐药性的新型生物标志物，此外整合多种miRNA可能较单一miRNA具有更有效并有更好的预测作用。

发明内容

针对现有技术不足，本发明提供一种前列腺癌患者预后复发风险预测标志工具及其风险评估模型的建立，提出8个MiRNA标志物作为前列腺癌患者预后复发风险预测的标志工具，提高预测准确性，同时建立风险评估模型，有效评测不同患者预后的风险，提升检测效率，适宜推广使用。

为实现以上目的，本发明的技术方案通过以下技术方案予以实现：

一种前列腺癌患者预后复发风险预测标志工具，其特征在于，所述标志工具为8个MiRNA标志物，分别为hsa-mir-10a、hsa-mir-10b、 hsa-mir-206、hsa-mir-21、hsa-mir-221、hsa-mir-222、hsa-mir-30e、 hsa-mir-340。

所述预后复发风险评估模型的建立包括以下步骤：

(1)检验数据的选择：分别从癌症基因组图谱TCGA下载多名前列腺癌患者无复发生存率信息，从纪念斯隆凯特琳癌症中心 MSKCC数据集中收集多名前列腺癌患者的miRNA谱和临床特征，作为检验数据集；

(2)预后标志物的筛选：将TCGA队列的前列腺癌患者随机分成训练集和检验集，将MSKCC队列的患者作为外部检验集，通过套索算法比例风险LASSO Cox回归模型筛出前列腺癌患者的无复发生存率相关的miRNA候选标志物；

(3)模型建立：基于LASSO Cox回归模型系数β产生的回归系数co-ef与miRNA候选标志物的线性相关性建立无复发生存率RFS 相关的miRNA预测模型；

(4)风险评分公式：采用(βmiRNA#1*miRNA#1表达水平)+ (βmiRNA#2*miRNA#2表达水平)+(βmiRNA#3*miRNA#3表达水平)+…+(βmiRNA#n*miRNA#n表达水平)公式来进行风险评分，并设置临界值为0，当临界值﹥0为高风险，当临界值﹤0为低风险；