[发明专利]用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒及其使用方法在审
申请号: | 201910689793.5 | 申请日: | 2019-07-29 |
公开(公告)号: | CN112301124A | 公开(公告)日: | 2021-02-02 |
发明(设计)人: | 戴应;宋卓;高堂杰;王益民;何庆;周巧 | 申请(专利权)人: | 人和未来生物科技(长沙)有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12Q1/6858;C12N15/11 |
代理公司: | 湖南兆弘专利事务所(普通合伙) 43008 | 代理人: | 邹大坚;黄丽 |
地址: | 410000 湖南省长沙市长沙高*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 直肠癌 腺瘤 辅助 诊断 试剂盒 及其 使用方法 | ||
1.一种用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒,其特征在于,包括引物组合物、探针组合物和封闭序列组合物,所述引物组合物由用于检测NDRG4基因的引物对BS-N4-F和BS-N4-R、用于检测SDC2基因的引物对BS-SDC2-F和BS-SDC2-R以及用于检测作为内参的ACTB基因的引物对BS-ACT-F和BS-ACT-R组成,
所述BS-N4-F的DNA序列如SEQ ID NO.1所示,
所述BS-N4-R的DNA序列如SEQ ID NO.2所示,
所述BS-SDC2-F的DNA序列如SEQ ID NO.3所示,
所述BS-SDC2-R的DNA序列如SEQ ID NO.4所示,
所述BS-ACT-F的DNA序列如SEQ ID NO.5所示,
所述BS-ACT-R的DNA序列如SEQ ID NO.6所示,
所述探针组合物由NDRG4基因的探针BS-N4-P、SDC2基因的探针BS-SDC2-P和ACTB基因的探针BS-ACT-P组成,
所述BS-N4-P的DNA序列如SEQ ID NO.7所示,
所述BS-SDC2-P的DNA序列如SEQ ID NO.8所示,
所述BS-ACT-P的DNA序列如SEQ ID NO.9所示,
所述封闭序列组合物由NDRG4基因的封闭序列BS-N4-C和SDC2基因的封闭序列BS-SDC2-C组成,
所述BS-N4-C的DNA序列如SEQ ID NO.10所示,
所述BS-SDC2-C的DNA序列如SEQ ID NO.11所示。
2.根据权利要求1所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒,其特征在于,所述BS-N4-C和所述BS-SDC2-C的3’端均进行磷酸化修饰。
3.根据权利要求1所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒,其特征在于,所述BS-N4-P采用ROX和BHQ2标记,所述BS-SDC2-P采用CY5和BHQ2标记,所述BS-ACT-P采用HEX和BHQ1标记。
4.根据权利要求1所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒,其特征在于,所述引物组合物中各引物的浓度为0.1μM~0.2μM,所述探针组合物中各探针的浓度为0.1μM~0.2μM,所述封闭序列组合物中各封闭序列的浓度为0.1μM~0.2μM。
5.根据权利要求1~4中任一项所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括Hot start Taq酶、10×buffer、dNTPs、NH4Cl、DMSO和去离子水。
6.根据权利要求5所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒,其特征在于,所述dNTPs浓度为10mM,所述NH4Cl的浓度为250mM,所述DMSO的体积浓度为100%。
7.一种如权利要求1~6中任一项所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒的使用方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)采样:采集粪便样本置于粪便样本保护液中;
(2)提取:采用磁珠法进行粪便DNA提取;
(3)转化:对提取的粪便DNA进行重亚硫酸盐转化及纯化;
(4)检测:将转化及纯化后的粪便DNA用试剂盒进行荧光定量PCR检测;
(5)结果分析:当ACTB基因的CT值<37时,NDRG4基因的CT值<37或SDC2基因的CT值<42,判断为阳性;
当ACTB基因的CT值<37时,NDRG4基因的CT值≥37且SDC2基因的CT值≥42,判断为阴性;
当ACTB基因的CT值≥37时,检测结果无效,需重新检测。
8.根据权利要求7所述的用于结直肠癌和腺瘤辅助诊断的试剂盒的使用方法,其特征在于,所述步骤(4)中,所述荧光定量PCR检测的反应程序为:50℃预变性2min,95℃变性10min,然后以95℃变性15s、60℃退火30s为一个循环进行45次,最后20℃保持2min。
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