[发明专利]基于HLA-KIR基因检测结果评估HBV携带者肝癌风险的方法在审
| 申请号： | 201910698006.3 | 申请日： | 2019-07-31 |
| 公开（公告）号： | CN110570900A | 公开（公告）日： | 2019-12-13 |
| 发明（设计）人： | 高素青;全湛柔;洪文旭;徐筠娉;张艳艳;钟艳平;陈浩;邹红岩;邓志辉 | 申请（专利权）人： | 深圳市血液中心 |
| 主分类号： | G16B20/00 | 分类号： | G16B20/00;C12Q1/6886 |
| 代理公司： | 44101 深圳市中知专利商标代理有限公司 | 代理人： | 张学群 |
| 地址： | 518000 广东省深*** | 国省代码： | 广东;44 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 风险因素 评估对象 携带 肝癌 基础数据库 基因分型 基因检测 结果评估 评估结果 综合计算 分类表 采集 基因 评估 | ||
1.一种基于HLA-KIR基因检测结果评估HBV携带者肝癌风险的方法，其特征在于，包括以下步骤：
步骤一、HBV携带者阳性被纳入评估对象；
步骤二、采集评估对象的性别、年龄、籍贯、民族；
步骤三、HLA/KIR基因分型；
步骤四，建立HLA-KIR基因名称基础数据库；
步骤五、建立风险因素分类表；
步骤六、根据表各项风险因素综合计算，从而评估携带HBV感染者发展为肝癌风险。
2.根据权利要求1所述的一种基于HLA-KIR基因检测结果评估HBV携带者肝癌风险的方法，其特征在于，所述步骤三包括：
3.1 用含EDTA抗凝剂血样管，采集被评估者外周血5ml，用5％EDTA抗凝，独立包装至－40℃保存，待用；
3.2 基因组DNA制备：将3.1步抗凝血200μl，使用全自动核酸提取试剂制备全基因组DNA，测定DNA浓度30～100ng/μL，纯度A260/280为1.65～2.0；
3.3 检测被评估者HLA-KIR基因型；采用通过资质评审的试剂供应商供应的HLA基因测序试剂盒及KIR PCR-SSP或基因测序试剂盒，按试剂盒操作说明完成受试者HLA-KIR基因型检测。
3.根据权利要求1所述的一种基于HLA-KIR基因检测结果评估HBV携带者肝癌风险的方法，其特征在于，所述步骤六包括：
6.1 采用贝叶斯网络计算模型建立风险因素贝叶斯信念网络图，各风险因素为输入状态，HLA-KIR易感基因为输出状态；
6.2 计算有向无环图(DAG)的权重；
6.3 风险因素概率计算公式如下:
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