[发明专利]一种木材靶向细胞DNA提取方法有效
申请号: | 201910705464.5 | 申请日: | 2019-07-31 |
公开(公告)号: | CN110408613B | 公开(公告)日: | 2020-10-27 |
发明(设计)人: | 焦立超;陆杨;殷亚方;何拓;李姗 | 申请(专利权)人: | 中国林业科学研究院木材工业研究所 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10;C12Q1/6806 |
代理公司: | 北京和信华成知识产权代理事务所(普通合伙) 11390 | 代理人: | 胡剑辉 |
地址: | 100091 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 木材 靶向 细胞 dna 提取 方法 | ||
1.一种木材靶向细胞DNA提取方法,其特征在于:去除木材表面外源污染,利用细胞化学方法并结合显微技术定位和分离富集DNA的靶向细胞,并加入DNA裂解液、除杂、沉淀、溶解、纯化和巢式PCR扩增高效提取木材DNA;包括以下步骤:
(1)从木材组织中切取体积为V的木材样品,去除木材表面外源污染;
(2)将步骤(1)得到的木材样品切取木材径切面切片,使用细胞化学方法并结合显微技术检测木材细胞中DNA的含量与分布,确定富集DNA的靶向细胞;木材切片厚度与木材靶向细胞弦向直径大小相同;
(3)将步骤(2)得到的木材径切面切片置于载玻片上,使用1.0-5.0mMDAPI溶液将木材径切面切片染色10-60min后,再用0.1-0.5M磷酸盐缓冲液洗涤3次,通过荧光显微技术观测DNA分布位置,同时确定富集DNA的靶向细胞,在倒置显微镜下利用无菌解剖刀分离木材靶向细胞,收集于离心管中;所述的靶向细胞为薄壁细胞;
(4)将步骤(3)得到的装有木材靶向细胞容器中加入DNA裂解液,混匀后置于水浴加热,将容器冷却,再加入除杂缓冲液,混匀后离心;
(5)将步骤(4)得到的上清液转移至新容器中,向新容器中加入DNA沉淀缓冲液,用移液器混匀后离心;
(6)将步骤(5)中得到的上清液弃掉,向新容器中加入清洗缓冲液,离心清洗;
(7)向步骤(6)得到的沉淀有DNA的新容器中加入双蒸水,静置溶解,得到DNA提取液;
(8)将步骤(7)得到的DNA作为模板,加入到反应体系中进行PCR扩增反应,得到DNA目的片段;
步骤(4)中,加入4.5ml DNA裂解液充分震荡混匀,55℃裂解5h;冷却后按照体积比加入1.0倍体积的除杂缓冲液,混匀5-20min后离心,离心速率为5000-15000rpm,离心时间为5-15min;
所述的DNA裂解液为:55mM CTAB、100mM Tris-HCl、1.4M NaCl、20mM EDTA、1%(w/v)BoricAcid和3%(w/v)PVP-40;然后加入20M蛋白酶K和1M DTT;体积比为30:5:1;
步骤(5)中DNA沉淀缓冲液包括异丙醇、醋酸钠和糖原,体积比为500:200:2;步骤(5)中向新离心管中按照体积比加入0.5倍体积的DNA沉淀缓冲液,混匀于2-6℃静置后离心,离心速率为5000-15000rpm,离心时间为1-15min;步骤(8)中的PCR扩增反应体系包括:2U DNA聚合酶、2.0mM MgCl2、200μM单一dNTP、0.1-5.0μM单一引物、pH7.0的0.1mg/ml牛血清白蛋白和10ng模板DNA。
2.如权利要求1所述的木材靶向细胞DNA提取方法,其特征在于:所述体积为V为7~13mm×7~13mm×7~13mm;所述木材径切面切片是使用滑走式切片机切取;所述的容器为离心管;所述的步骤(4)中混匀是涡旋振荡混匀;所述的水浴加热是置于摇床台上水浴加热;所述去除木材表面外源污染包括表面切除、和/或消毒处理、和/或激光辐射净化;所述的步骤(2)中细胞化学方法检测木材细胞中DNA的含量与分布。
3.如权利要求1至2任一所述的木材靶向细胞DNA提取方法,其特征在于:去除木材表面外源污染包括使用激光辐射扫描木材样品表面,然后将木材样品置于次氯酸钠浸泡,然后使用解剖刀将木材样品外表面切除;
所述的步骤(6)中离心速率为5000-15000rpm,离心时间为1-15min;
所述的步骤(7)中静置溶解是指在2-6℃环境下静置溶解。
4.根据权利要求3所述的木材靶向细胞DNA提取方法,其特征在于:所述的激光辐射,为100-1200W,10-50Hz;去除木材表面外源污染的方法包括:使用激光辐射扫描木材样品表面,扫描速度1-3cm/s,2个循环,然后将木材样品置于1%-10%次氯酸钠浸泡10-60min,然后使用无菌的解剖刀将木材样品外表面切除1-4mm;
步骤(5)低温为4℃;所述的步骤(7)中静置溶解是指在4℃环境下静置溶解。
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