[发明专利]一种RAA荧光法检测非洲猪瘟病毒24个基因型通用引物、探针及检测方法有效
申请号: | 201910717729.3 | 申请日: | 2019-08-05 |
公开(公告)号: | CN110453012B | 公开(公告)日: | 2023-07-25 |
发明(设计)人: | 应清界;吴晓东;樊晓旭;李林;郭利川;蔡禹希;王智宏 | 申请(专利权)人: | 江苏奇天基因生物科技有限公司;中国动物卫生与流行病学中心 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 | 代理人: | 王敏 |
地址: | 214135 江苏省无锡市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 raa 荧光 检测 非洲 猪瘟 病毒 24 基因型 通用 引物 探针 方法 | ||
1.一种RAA荧光法非诊断治疗目的检测非洲猪瘟病毒24个基因型的检测方法,其特征在于,具体步骤如下:
(1)提取待检样本DNA,获得DNA提取液;
(2)将恒温荧光基因检测仪接通电源进行预热,对反应参数进行设置;
(3)在42.5μL反应缓冲液中加入浓度为10μM的2μL引物和0.5μL探针,充分混合后添加到RAA荧光基础反应试剂中混合,得到反应预混液;
(4)将5μL所述步骤(1)中得到的DNA提取液与所述步骤(3)中得到的反应预混液充分混合,得到的反应体系放入恒温荧光基因检测仪检测荧光信号;
(5)根据扩增情况,在15分钟内有扩增曲线,判定为阳性;在15分钟内无扩增曲线,判定为阴性;
所述反应参数设置为39℃,反应时间:15分钟;
RAA荧光法检测非洲猪瘟病毒24个基因型的引物序列如下:
上游引物:5’-TAGTGATAGACCCCACGTAATCCGTGTCCCAAC-3’;SEQ ID NO.3;
下游引物:5’-CGATGATCCGGGTGCGATGATGATTACCTT-3’;SEQ ID NO.7;
所述上游引物和下游引物的使用浓度为10μM;
RAA荧光法检测非洲猪瘟病毒24个基因型的探针序列如下:
5’-GATACGTTAATATGACCACTGGGTTGGTATTCCTCCCGTGGCTTCAAAG-3’;SEQ ID NO.8;所述探针采用荧光报告基团和荧光淬灭基团进行修饰,荧光报告基团修饰在探针序列离5’端碱基数31bp的位置上;荧光淬灭基团修饰在探针序列离3’端碱基数16bp的位置上,荧光报告基团与淬灭基团之间间隔2个碱基CC,其中靠近3’端碱基C用四氢呋喃残基替换;
所述荧光报告基团为FAM、HEX、TET、JOE或VIC;所述荧光淬灭基团为BHQ1、BHQ2或BHQ3;
所述荧光报告基团为FAM;所述荧光淬灭基团为BHQ1;
所述探针的浓度为5~40μM。
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