[发明专利]一种RAA荧光法检测非洲猪瘟病毒24个基因型通用引物、探针及检测方法有效

专利信息
申请号: 201910717729.3 申请日: 2019-08-05
公开(公告)号: CN110453012B 公开(公告)日: 2023-07-25
发明(设计)人: 应清界;吴晓东;樊晓旭;李林;郭利川;蔡禹希;王智宏 申请(专利权)人: 江苏奇天基因生物科技有限公司;中国动物卫生与流行病学中心
主分类号: C12Q1/70 分类号: C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93
代理公司: 北京慕达星云知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11465 代理人: 王敏
地址: 214135 江苏省无锡市*** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 一种 raa 荧光 检测 非洲 猪瘟 病毒 24 基因型 通用 引物 探针 方法
【权利要求书】:

1.一种RAA荧光法非诊断治疗目的检测非洲猪瘟病毒24个基因型的检测方法,其特征在于,具体步骤如下:

(1)提取待检样本DNA,获得DNA提取液;

(2)将恒温荧光基因检测仪接通电源进行预热,对反应参数进行设置;

(3)在42.5μL反应缓冲液中加入浓度为10μM的2μL引物和0.5μL探针,充分混合后添加到RAA荧光基础反应试剂中混合,得到反应预混液;

(4)将5μL所述步骤(1)中得到的DNA提取液与所述步骤(3)中得到的反应预混液充分混合,得到的反应体系放入恒温荧光基因检测仪检测荧光信号;

(5)根据扩增情况,在15分钟内有扩增曲线,判定为阳性;在15分钟内无扩增曲线,判定为阴性;

所述反应参数设置为39℃,反应时间:15分钟;

RAA荧光法检测非洲猪瘟病毒24个基因型的引物序列如下:

上游引物:5’-TAGTGATAGACCCCACGTAATCCGTGTCCCAAC-3’;SEQ ID NO.3;

下游引物:5’-CGATGATCCGGGTGCGATGATGATTACCTT-3’;SEQ ID NO.7;

所述上游引物和下游引物的使用浓度为10μM;

RAA荧光法检测非洲猪瘟病毒24个基因型的探针序列如下:

5’-GATACGTTAATATGACCACTGGGTTGGTATTCCTCCCGTGGCTTCAAAG-3’;SEQ ID NO.8;所述探针采用荧光报告基团和荧光淬灭基团进行修饰,荧光报告基团修饰在探针序列离5’端碱基数31bp的位置上;荧光淬灭基团修饰在探针序列离3’端碱基数16bp的位置上,荧光报告基团与淬灭基团之间间隔2个碱基CC,其中靠近3’端碱基C用四氢呋喃残基替换;

所述荧光报告基团为FAM、HEX、TET、JOE或VIC;所述荧光淬灭基团为BHQ1、BHQ2或BHQ3;

所述荧光报告基团为FAM;所述荧光淬灭基团为BHQ1;

所述探针的浓度为5~40μM。

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