[发明专利]一种生物学序列的数据库保存方法和系统在审

专利信息
申请号: 201910719765.3 申请日: 2019-08-06
公开(公告)号: CN110544512A 公开(公告)日: 2019-12-06
发明(设计)人: 蓝田;李钟文;岑文杰 申请(专利权)人: 云舟生物科技(广州)有限公司
主分类号: G16B50/30 分类号: G16B50/30
代理公司: 44202 广州三环专利商标代理有限公司 代理人: 颜希文;麦小婵<国际申请>=<国际公布>
地址: 510663 广东省广州市广州高新技术产业开发区科*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 生物学序列 保存 信息复杂度 解析结果 数据使用 网络传输 信息构建 解析 数据库 关联 通用
【权利要求书】:

1.一种生物学序列的数据库保存方法,包括如下步骤:

步骤S1,根据将生物学序列的通用保存格式内有关生物学序列的信息构建若干用于保存生物学序列部分信息的数据表,且各数据表通过特定逻辑进行关联;

步骤S2,获取生物学序列信息,对所获取的生物学序列信息进行解析,依据解析结果将生物学序列信息的各部分存入对应的数据表。

2.如权利要求1所述的一种生物学序列的数据库保存方法,其特征在于,于步骤S2后,还包括如下步骤:

步骤S3,对各数据表设计数据接口,以通过数据接口实现对各数据表中的生物学学列信息的操作。

3.如权利要求2所述的一种生物学序列的数据库保存方法,其特征在于:于步骤S1中,构建包括但不限于如下用于保存生物学序列部分信息的数据表:分别为annotation表,type表,component表,node表以及annotation_types表,所述annotation表用于保存生物学序列信息的名称和对应的描述信息,所述type表用于保存生物学序列信息的类型,所述component表用于保存生物学序列的hashcode和序列本身,所述node表用于保存生物学序列的进化树节点,所述annotation_types表用于建立annotation表与type表的关系。

4.如权利要求3所述的一种生物学序列的数据库保存方法,其特征在于:于步骤S2中,对所述生物学序列信息进行解析,获取该生物学序列信息中生物学序列信息的名称和对应的描述信息,将其存入所述annotation表中,并生成annotation_id,获取该生物学序列信息中的生物学序列信息的类型,将其存入所述type表中,并生成type_id,获取该生物学序列信息中的hashcode和序列本身,将其存入所述component表中,并生成component_id,获取该生物学序列信息中的进化树节点,将其存入所述node表中,并生成node_id,根据annotation_id和type_id建立所述annotation_types表,最后各数据表之间利用各表的ID进行关联。

5.如权利要求4所述的一种生物学序列的数据库保存方法,其特征在于:于步骤S3中,通过所述数据接口实现对生物学学列信息的增删改查目的。

6.一种生物学序列的数据库保存系统,包括:

数据表构建单元,用于根据将生物学序列的通用保存格式内有关生物学序列的信息构建若干用于保存生物学序列部分信息的数据表,且各数据表通过特定逻辑进行关联;

解析存储单元,用于获取生物学序列信息,对所获取的生物学序列信息进行解析,依据解析结果将生物学序列信息的各部分存入对应的数据表。

7.如权利要求6所述的一种生物学序列的数据库保存系统,其特征在于,所述系统还包括:

数据接口设计单元,用于对各数据表设计数据接口,以通过数据接口实现对各数据表中的生物学学列信息的操作。

8.如权利要求7所述的一种生物学序列的数据库保存系统,其特征在于:所述数据表构建单元构建包括但不限于如下用于保存生物学序列部分信息的数据表:分别为annotation表,type表,component表,node表以及annotation_types表,所述annotation表用于保存生物学序列信息的名称和对应的描述信息,所述type表用于保存生物学序列信息的类型,所述component表用于保存生物学序列的hashcode和序列本身,所述node表用于保存生物学序列的进化树节点,所述annotation_types表用于建立annotation表与type表的关系。

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