[发明专利]辣椒细胞质雄性不育恢复性状相关的SNP标记及其特异性引物和应用有效
申请号: | 201910724935.7 | 申请日: | 2019-08-07 |
公开(公告)号: | CN110468225B | 公开(公告)日: | 2022-05-31 |
发明(设计)人: | 张正海;王立浩;曹亚从;于海龙;张宝玺;朱砚姝 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院蔬菜花卉研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京法信智言知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 11737 | 代理人: | 刘静荣 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 辣椒 细胞质 雄性不育 恢复 性状 相关 snp 标记 及其 特异性 引物 应用 | ||
1.一种辅助筛选辣椒细胞质雄性不育恢复系的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
使用引物对检测SNP标记S1431和SNP标记S1436,以筛选辣椒雄性不育恢复基因,所述SNP标记S1431和所述SNP标记S1436为与辣椒细胞质雄性不育恢复性状相关的SNP标记,
其中,
所述SNP标记S1431在SEQ ID No.1所示序列的第25位碱基为T或C,所述第25位碱基为所述SNP标记S1431的SNP位点;
所述SNP标记S1436在SEQ ID No.2所示序列的第25位碱基为T或G,所述第25位碱基为所述SNP标记S1436的SNP位点;
当待测辣椒在SNP标记S1431和SNP标记S1436的SNP位点处的碱基均为T:T基因型时,则待测辣椒材料为“恢复系”。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,使用KASP特异性引物组对待筛选辣椒材料进行荧光PCR扩增,所述KASP特异性组由引物对1和引物对2组成,其中,所述引物对1的序列如下:
前引物A1: 5′-GGGCATCAATAACAATGGTATAGT-3′,
前引物A2: 5′-AGGGCATCAATAACAATGGTATAGC-3′,
后引物: 5′- AGGGGTCATACTCAAAAGACTATAAGT -3′;
所述引物对2的序列如下:
前引物A1: 5′-TTGCATAGTCCATCAATCACCATGT-3′,
前引物A2: 5′-TTGCATAGTCCATCAATCACCATGT-3′,
后引物: 5′- GGACTTTCTTCTCTGAGATGGTGAA -3′,
所述前引物A1的5’端加有FAM荧光标签序列,所述前引物A2的5’端加有HEX荧光标签序列。
3.根据权利要求2所述的方法,其特征在于,所述FAM荧光标签序列为GAAGGTGACCAAGTTCATGCT,所述HEX荧光标签序列为GAAGGTCGGAGTCAACGGATT。
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