[发明专利]人类Y染色体STR基因座和InDel位点的荧光标记复合扩增试剂盒及其应用

说明书

本发明属于生物学检测技术领域，具体公开了人类Y染色体STR基因座和InDel位点的荧光标记复合扩增试剂盒，试剂盒共包括41对特异性引物，可在单管中扩增37个Y染色体STR基因座和8个Y染色体InDel位点。本发明具有特异性强、分型准确、灵敏度度高等特点，同时加入的8个InDel位点，可在一定程度上对样本的家系进行区分。本发明可满足案件检测、数据库建设以及亲子鉴定等多方面需求。

技术领域

本发明属于法医遗传学领域，涉及一种荧光标记复合扩增检验系统，具体为人类Y染色体STR基因座和InDel位点的荧光标记复合扩增试剂盒及其应用。

背景技术

短串联重复序列基因座(short tandem repeat，STR)作为继限制性片段长度多态性之后的第二代遗传标记，自二十世纪八九十年代以来，被广泛应用于法医物证学方面相关的研究及鉴定，是目前应用最广泛的遗传标记之一。STR标记与其他遗传标记物相比，STR基因座片段小、容易扩增，更适用于微量和降解检材，且多个STR基因座可以同时进行复合扩增，具有快速、高效、准确、灵敏、信息量大等优点，被广泛应用于法医物证中的个体识别和亲子鉴定。Y染色体STR遗传标记是指存在于人类Y染色体非重组区域的短串联重复序列。Y染色体STR遗传标记与常染色体STR遗传标记相比，具有男性特有、父系遗传及单倍型遗传等三大特征，可用于法医学个体识别、亲子鉴定及DNA家谱构建等。

InDel多态性是人类基因组中一种特殊类型的二等位基因遗传标记，表现为基因组中插入或缺失了不同大小的小片段。InDel作为新一代的法医遗传学鉴定标记，与STR相比，InDel的优点主要体现在：(1)相对较低的突变率(2.3×10^-9)，比STR(10^-3)和SNPs(2.3×10^-8)更稳定；(2)扩增目标片段相对较短，更适合于降解检材的检验分析；(3)由于基因频率存在地域性的差异，因此Y-InDel遗传标记不仅可以用于个体的识别，还可以作为分析祖先相关的信息位点以此来区分人群；(4)易于分型，可以用常规的电泳分型或者是高通量的自动化分型方法,无stutter产物。

Y-STR与Y-InDel拥有各自的特点与优势。就单个基因座的多态性而言，Y-STR要明显高于Y-InDel。而就遗传稳定性来说，Y-InDel的突变率要远低于Y-STR。根据两者的特点，将两者联合使用，在保证试剂盒包含足够多的Y-STR基因座拥有较高个体识别能力的同时，增加部分Y-InDel位点，可用于快速区分部分样本是否来自同一家系，在家系排查方面具有一定的作用。

目前，市面上部分试剂盒已同时包含Y-STR与Y-InDel，如：AGCU Y37+5、Y FilerPlatinum、DNA Typer 36Y、Goldeneye DNA 38Y等，但这些试剂盒中一般包含Y-InDel位点在3-5个，数量较少，难以对样本家系进行有效地区别，本发明在使用37个Y-STR的基础上增加了8个Y-InDel位点，大大提高了试剂盒对家系的区分能力，同时37个Y-STR对不同男性个体有较强的识别能力。

发明内容

解决的技术问题：为了克服现有技术的缺陷，获得一种具有高分辨率且能够满足Y染色体DNA数据库建设及男性个体家系排查的试剂盒，本发明提供了人类Y染色体STR基因座和InDel位点的荧光标记复合扩增试剂盒及其应用。

技术方案：人类Y染色体STR基因座和InDel位点的荧光标记复合扩增试剂盒，所述试剂盒包括扩增37个Y-STR基因座与8个Y-InDel位点的特异性引物；