[发明专利]组合标签、组合标签接头及其应用在审
申请号: | 201910741578.5 | 申请日: | 2019-08-12 |
公开(公告)号: | CN110331187A | 公开(公告)日: | 2019-10-15 |
发明(设计)人: | 宋炎;张娜;刘玉朋;邵林 | 申请(专利权)人: | 天津华大医学检验所有限公司;深圳华大基因股份有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C40B50/06;C40B70/00;C40B80/00 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 张立 |
地址: | 300308 天津市滨海新区自贸区(空港*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 组合标签 两组 标签序列 标签 汉明距离 测序 应用 基因测序 基因文库 接头序列 构建 样本 污染 | ||
1.一种组合标签,其特征在于,包括至少两组标签,所述至少两组标签的每一组含有至少两个标签序列,
所述至少两组标签的每一组内任意标签序列间的汉明距离大于等于2,优选大于等于3,
所述至少两组标签的每一组间任意标签序列间的汉明距离大于等于1,优选大于等于2。
2.根据权利要求1所述的组合标签,其特征在于,所述标签序列为4~10个碱基,优选为4~8个碱基;
任选地,所述标签序列的GC含量为20%~80%,例如为50%。
3.根据权利要求1所述的组合标签,其特征在于,所述标签序列上任意位置处碱基A、T、C、G占比分别为25%;
任选地,所述标签序列不含有连续3个相同的碱基。
4.根据权利要求1所述的组合标签,其特征在于,所述至少两组标签的每一组标签用于标记同一个样本。
5.一种组合标签接头,其特征在于,含有接头序列和组合标签,所述接头序列位于所述组合标签中标签序列的上游,所述组合标签为权利要求1~4中任一项所述的组合标签。
6.根据权利要求5所述的组合标签接头,其特征在于,包括选自下列中的至少一组:
SEQ ID NO:1~SEQ ID NO:4;
SEQ ID NO:5~SEQ ID NO:8;
SEQ ID NO:9~SEQ ID NO:12;
SEQ ID NO:13~SEQ ID NO:16;
SEQ ID NO:17~SEQ ID NO:20;
SEQ ID NO:21~SEQ ID NO:24;
SEQ ID NO:25~SEQ ID NO:28;
SEQ ID NO:29~SEQ ID NO:32。
7.一种试剂盒,其特征在于,包括组合标签和/或组合标签接头,所述组合标签为权利要求1~4中任一项所述的组合标签,所述组合标签接头为权利要求5或6所述的组合标签接头。
8.组合标签和/或组合标签接头在基因测序领域中的用途,所述组合标签为权利要求1~4中任一项所述的组合标签,所述组合标签接头为权利要求5或6所述的组合标签接头。
9.一种基因文库的构建方法,其特征在于,包括:
基于待测核酸样本,进行末端修复,加A,以便获得经修复的末端加A的核酸样本;
将所述经修复的末端加A的核酸样本和组合标签接头进行连接,以便获得连接有组合标签接头的核酸样本;
基于所述连接有组合标签接头的核酸样本,进行第一扩增,以便获得所述测序文库,所述组合标签接头为权利要求5或6所述的组合标签接头。
10.根据权利要求9所述的构建方法,其特征在于,利用引物进行所述第一扩增,所述引物的部分序列能够与所述组合标签接头的部分序列进行互补配对,所述引物上含有分子标签序列。
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