[发明专利]非小细胞肺癌靶向药物相关低频突变的多重富集检测方法有效

专利信息
申请号: 201910745351.8 申请日: 2019-08-13
公开(公告)号: CN110438210B 公开(公告)日: 2021-07-16
发明(设计)人: 陈红岩;陈弘远 申请(专利权)人: 复旦大学
主分类号: C12Q1/6858 分类号: C12Q1/6858;C12N15/11
代理公司: 上海科盛知识产权代理有限公司 31225 代理人: 褚明伟
地址: 200433 *** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 细胞 肺癌 靶向 药物 相关 低频 突变 多重 富集 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种非小细胞肺癌靶向药物相关低频突变的多重富集检测试剂盒,其特征在于,包括:针对每个突变位点分别设计的引物、阻抑子和标记不同荧光的TaqMan探针;

以人类EGFR基因外显子19上的缺失突变中频率最高的2235_2249del-15,2236_2250del-15、外显子20上的T790M突变和外显子21上的 L858R突变这四个突变作为靶标;

EGFR基因外显子19特异性核酸序列如 SEQ ID No.1所示;

EGFR基因外显子20特异性核酸序列如 SEQ ID No.2所示;

EGFR基因外显子21特异性核酸序列如 SEQ ID No.3所示;

EGFR基因外显子19正向引物为引物1,EGFR基因外显子19反向引物为引物2,EGFR基因外显子20正向引物为引物3,EGFR基因外显子20反向引物为引物4,EGFR基因外显子21正向引物为引物5,EGFR基因外显子21反向引物为引物6;

引物1:5’TTCCCGTCGCTATCAARAC 3’;

引物2:5’ACAGCAAAGCAGAAACTCAC 3’;

引物3:5’CACCGTGCAGCTCATCAT 3’;

引物4:5’AGCAGGTACTGGGAGCCAAT 3’;

引物5:5’TCAAGATCACAGATTTTGGGCG 3’;

引物6:5’GGAAAATGCTGGCTGACCTA 3’;

EGFR基因外显子19对应的阻抑子序列如SEQ ID No.13所示;

EGFR基因外显子20对应的阻抑子序列如SEQ ID No.14所示;

EGFR基因外显子21对应的阻抑子序列如SEQ ID No.15所示;

EGFR基因外显子19对应的TaqMan探针为探针1,EGFR基因外显子20对应的TaqMan探针为探针2,EGFR基因外显子21对应的TaqMan探针为探针3,

探针1:5’ATCGAGGATTTCCTTGTTGGCTTT 3’;

探针2:5’TGTCTTTGTGTTCCCGGACATAGT 3’;

探针3:5’CCTCCTTACTTTGCCTCCTTC 3’。

2.根据权利要求1所述非小细胞肺癌靶向药物相关低频突变的多重富集检测试剂盒,其特征在于,外显子19的探针标记ROX荧光基团和BHQ2淬灭基团,外显子20的探针标记CY5荧光基团和BHQ3淬灭基团,外显子21的探针标记FAM荧光基团和BHQ1淬灭基团。

3.根据权利要求1所述非小细胞肺癌靶向药物相关低频突变的多重富集检测试剂盒,其特征在于,

还包括针对β-actin基因设计的β-actin引物与β-actin探针,

所述β-actin基因上的靶序列如SEQ ID No.4所示;

β-actin引物包括引物7与引物8,引物7为β-actin正向引物,引物8为β-actin反向引物,

引物7:5’CCAGCAGATGTGGATCAGCAAG 3’;

引物8:5’AGCATTTGCGGTGGACGAT 3’;

β-actin探针为探针4:5’AGGAGTATGACGAGTCCGGC 3’;

探针4在5’端标记HEX荧光基团,3’端标记BHQ1淬灭基团。

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