[发明专利]一种基于深度学习的腹部CT图像目标器官配准方法有效
申请号: | 201910746634.4 | 申请日: | 2019-08-14 |
公开(公告)号: | CN110473196B | 公开(公告)日: | 2021-06-04 |
发明(设计)人: | 赵于前;杨少迪;杨振;张帆;廖胜辉 | 申请(专利权)人: | 中南大学 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G06T7/33;G06K9/32;G06K9/62;G06N3/04 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 410083 湖南省长沙市*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 基于 深度 学习 腹部 ct 图像 目标 器官 方法 | ||
1.一种基于深度学习的腹部CT图像目标器官配准方法,其特征在于包括以下步骤:
步骤1:构建腹部CT图像数据库:
首先,提取腹部图像序列切片中肝、左肾、右肾和脾的坐标信息,获取带有目标器官边界框的XML格式注释文件,再利用原始图像及其目标器官的坐标信息组成样本训练集、验证集和测试集;
步骤2:提取腹部目标器官感兴趣区域,具体包括以下步骤:
步骤2.1:构建基于深度学习的网络模型,具体包括以下步骤:
步骤2.1.1:以改进的卷积神经网络为第一模块,首先对输入图像进行自动补零,然后进入卷积操作,该操作共包含五个部分,其中第一部分包含1个坐标卷积层、批归一化层和池化层,第二部分包含1个残差块和2个恒等映射块,第三部分包含1个残差块和3个恒等映射块,第四部分包含1个残差块和5个恒等映射块,第五部分包含1个残差块和2个恒等映射块,最后进行池化、排序展平和全连接,实现特征图的提取,其中1个卷积层和1个批归一化层为1组卷积,每3组卷积增加一个短连接,构成1个恒等映射块,在短连接上加1组卷积,构成残差块;
步骤2.1.2:以区域生成网络为第二模块,将第一模块输出的特征图输入第二模块,经卷积层、池化层、全连接层,获得初步边界框的回归和分类;
步骤2.1.3:根据第二模块的边界框初步预测结果,取整裁剪第一模块输出的特征图,输入候选区域池化层,获得固定大小的特征图;
步骤2.1.4:将步骤2.1.3输出的特征图,输入全连接层,通过分类和回归获得目标器官的检测结果;
步骤2.2:训练网络模型:
首先利用自然场景公共数据库,预训练步骤2.1构建的网络模型,然后基于迁移学习技术,利用腹部CT图像数据库对预训练模型进行参数微调,获得腹部CT图像目标器官检测网络模型;
步骤2.3:检测腹部目标器官:
采用步骤2.2所得的网络模型检测测试集中的腹部目标器官,获得边界框的分类结果和坐标信息,提取测试集的肝、左肾、右肾和脾的感兴趣区域;
步骤3:构建腹部CT图像对目标器官感兴趣区域:
根据测试集中每个序列相应的目标器官检测结果,随机抽取1个序列图像作为参考,并将剩余序列图像依次与其配对,获得多组腹部CT图像对目标器官感兴趣区域;
步骤4:构建配准相似性度量函数:
其中,If为参考图像,Im为浮动图像,T为空间变换,S为配准目标函数,R为惩罚项,λ为平衡惩罚项和目标函数之间误差的权重系数,具体包括以下步骤:
步骤4.1:利用待配准图像对之间灰度分布的相关性,计算图像对所有像素点之间的误差平方和距离,构建配准目标函数:
其中,x为整体图像空间Ω中的像素点,为浮动图像Im的空间变换;引入复合梯度:
其中,K为恒等变换,它与T构成复合函数,用于保持空间变换域的平滑性,为的梯度算子;
步骤4.2:利用吉洪诺夫正则化,即Tikhonov正则化,约束配准目标函数,以构建惩罚项:
其中,I为恒等矩阵,为关于T对x求导,||·||F为图像对像素点之间灰度差的弗罗贝尼乌斯范数,即Frobenius范数;
步骤5:基于梯度下降算法最小化相似性度量函数,实现腹部CT图像对的目标器官配准。
2.如权利要求1所述的一种基于深度学习的腹部CT图像目标器官配准方法,其特征在于,所述步骤1中,腹部CT图像数据库包括:公开的数据库3D-IRCADb,LiTS和SLIVER07。
3.如权利要求1所述的一种基于深度学习的腹部CT图像目标器官配准方法,其特征在于,所述步骤2.1.1中,卷积神经网络选取ResNet50网络,且在卷积操作第一部分的第1个卷积层里添加含有坐标信息的通道,变为坐标卷积层,使用7×7个卷积核,卷积核大小为2×2,用于输出64个特征图。
4.如权利要求1所述的一种基于深度学习的腹部CT图像目标器官配准方法,其特征在于,所述步骤2.2中,自然场景公共数据库选取PASCAL VOC2007。
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