[发明专利]一种解脂耶氏酵母中目的基因多次无痕整合系统及方法有效
申请号: | 201910747704.8 | 申请日: | 2019-08-14 |
公开(公告)号: | CN110408645B | 公开(公告)日: | 2021-01-08 |
发明(设计)人: | 闫云君;周清华;焦梁成;阎金勇;杨凯欣;乔阳歌 | 申请(专利权)人: | 华中科技大学 |
主分类号: | C12N15/81 | 分类号: | C12N15/81;C12N15/65;C12R1/645 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 瞿晓晶 |
地址: | 430074 湖北*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 解脂耶氏 酵母 目的 基因 多次 整合 系统 方法 | ||
1.一种解脂耶氏酵母中目的基因多次无痕整合系统,其特征在于,所述系统包括质粒1、质粒2和质粒3;
所述质粒1包括酵母筛选标记、Cre基因表达盒、细菌部分基因片段、同源片段A和两个同向lox位点;两个同向lox位点设在同源片段A两侧,其余元件无顺序要求;两个同向lox位点整合到酵母基因组后发生重组反应,反应后在基因组上生成一个左臂突变型lox位点或一个右臂突变型lox位点;所述同源片段A为解脂耶氏酵母基因组序列,长度不小于1000bp;
所述质粒2包括酵母筛选标记、Cre基因表达盒、细菌部分基因片段、同源片段B、两个反向互补的左或右臂突变lox位点和目的基因表达盒;两个反向互补的左或右臂突变lox位点需在目的基因表达盒两侧,且紧靠同源片段B,其余元件无顺序要求;两个反向互补的左或右臂突变lox位点能够与质粒1反应后在基因组上生成的左或右臂突变型lox位点发生重组反应,反应后在基因组生成双臂突变型位点;所述同源片段B位于同源片段A上游或下游序列,长度不小于1000bp;
所述质粒3包括酵母筛选标记、Cre基因表达盒、细菌部分基因片段、同源片段B、两个反向互补的左或右臂突变lox位点和目的基因表达盒;两个反向互补的左或右臂突变lox位点需在目的基因表达盒两侧,且紧靠同源片段B,其余元件无顺序要求;两个反向互补的左或右臂突变lox位点能够与质粒2反应后在基因组生成的左或右臂突变型lox位点发生重组反应,反应后在基因组生成双臂突变型位点;同源片段B位于同源片段A上游或下游序列,长度不小于1000bp;
所述酵母筛选标记包括营养缺陷型标记和抗生素抗性标记;
所述Cre基因表达盒由诱导启动子-Cre基因-终止子组成;
所述细菌部分基因片段包括大肠杆菌复制起点和抗性基因。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述质粒1中的两个同向lox位点包括四个组合:5’-左臂突变型lox位点和3’-左臂突变型lox位点的组合、5’-左臂突变型lox位点和3’-野生lox位点的组合、5’-右臂突变型lox位点和3’-右臂突变型lox位点的组合以及5’-野生lox位点和3’-右臂突变型lox位点的组合。
3.根据权利要求1或2所述的系统,其特征在于,当所述质粒1中的两个同向lox位点为5’-左臂突变型lox位点和3’-左臂突变型lox位点的组合或5’-左臂突变型lox位点和3’-野生lox位点的组合时,质粒1反应后在基因组上生成一个左臂突变型lox位点,质粒2含两个反向互补的右臂突变lox位点,质粒3含两个反向互补的左臂突变lox位点;当所述质粒1中的两个同向lox位点为5’-右臂突变型lox位点和3’-右臂突变型lox位点的组合或5’-野生lox位点和3’-右臂突变型lox位点的组合时,质粒1反应后在基因组上生成一个右臂突变型lox位点,质粒2含两个反向互补的左臂突变lox位点,质粒3含两个反向互补的右臂突变lox位点。
4.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,同源片段B位于同源片段A的相对位置影响质粒2和质粒3中同源片段B、两个反向互补的左或右臂突变lox位点、目的基因表达盒的相对位置:
当所述同源片段B位于同源片段A下游序列时,5’到3’的顺序为:lox位点1-目的基因表达盒-lox位点2-同源片段B;
当所述同源片段B位于同源片段A上游序列时,5’到3’的顺序为:同源片段B-lox位点2-目的基因表达盒-lox位点1;
同一质粒中,所述lox位点1和lox位点2反向互补;
质粒2中同源片段B紧邻lox反向互补序列,质粒3中同源片段B紧邻lox位点;
质粒2中的lox位点1与质粒1反应后在基因组上生成的lox位点同向,但突变型相反:一个为左臂突变型,一个为右臂突变型;
质粒3中的lox位点与质粒1反应后在基因组上生成的lox位点方向相反,但突变型相同:同为左臂突变型或同为右臂突变型。
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