[发明专利]一种用于海马药材鉴定的引物、DNA序列及鉴定方法有效
申请号: | 201910753225.7 | 申请日: | 2019-08-15 |
公开(公告)号: | CN110484633B | 公开(公告)日: | 2023-05-23 |
发明(设计)人: | 葛宇清;张光霁;程汝滨;孙思雅;来梦茹 | 申请(专利权)人: | 浙江中医药大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6869;C12N15/11 |
代理公司: | 杭州赛科专利代理事务所(普通合伙) 33230 | 代理人: | 施王蓉 |
地址: | 310005 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 用于 海马 药材 鉴定 引物 dna 序列 方法 | ||
1.一种海马药材的分子鉴定方法,其特征在于,包括下列步骤:
1)用SDS裂解法提取待测海马药材的基因组DNA,保存于-20摄氏度;
2)采用ATP-F和ATP-R引物对步骤1)提取的基因组DNA作PCR扩增;
ATP-F:5'-CAACCCCTTGAAACTGACAATGACA-3'
ATP-R:5'-GCTTGRATTATAGCAACGGCTACTTC-3';
3)扩增产物在琼脂糖凝胶上电泳,SYBRGreen染色,观察DNA扩增结果;
4)对扩增获得的DNA片段进行回收和纯化;
5)将纯化后DNA片段做双向测序反应;
6)将测得ATP6序列与SEQ ID NO:3-68作序列比对,计算遗传距离;
7)根据比对结果,判定待测海马样品的种类;
待测样品的ATP6序列与SEQ ID NO:3-13序列间的遗传距离小于或等于0.012,且ATP6序列与SEQ ID NO:14-68序列间的遗传距离大于或等于0.138,则待测海马样品就是三斑海马Hippocampustrimacu latus;
待测海马样品的ATP6序列与SEQ ID NO:14-25序列间的遗传距离小于或等于0.015,且ATP6序列与SEQ ID NO:3-13和SEQ ID NO:26-68序列间的遗传距离大于或等于0.094,则待测海马样品就是棘海马Hi ppocampusspinosissimus;
待测海马样品的ATP6序列与SEQ ID NO:26-35序列间的遗传距离小于或等于0.0101,且ATP6序列与SEQ ID NO:3-25和SEQ ID NO:36-68序列间的遗传距离大于或等于0.0597,则待测海马样品就是太平洋海马Hippocampusingens;
待测海马样品的ATP6序列与SEQ ID NO:36-47序列间的遗传距离小于或等于0.013,且ATP6序列与SEQ ID NO:3-35和SEQ ID NO:48-68序列间的遗传距离大于或等于0.155,则待测海马样品就是直立海马Hippocampuserectus;
待测海马样品的ATP6序列与SEQ ID NO:48-55序列间的遗传距离小于或等于0.003,且ATP6序列与SEQ ID NO:3-47和SEQ ID NO:56-68序列间的遗传距离大于或等于0.126,则待测海马样品就是鲍氏海马Hippocampusbarbouri。
2.根据权利要求1所述海马药材的分子鉴定方法,其特征在于,步骤2)所述PCR扩增体系为:反应总体系为50μL,其中10×PCRbuffer5μL,rTaq酶0.5μL,dNTPMix5μL,正向引物1μL,反向引物1μL,模板DNA200ng,加超纯水补充至50μl。
3.根据权利要求1所述海马药材的分子鉴定方法,其特征在于,步骤2)所述PCR扩增条件为:94℃预变性5分钟;94℃变性45秒,48-53℃退火1分钟,72℃延伸1分钟,35个循环;72℃延伸15分钟。
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