[发明专利]一种日本沼虾常规育种中预测和避免近交程度的方法在审

专利信息
申请号: 201910759129.3 申请日: 2019-08-16
公开(公告)号: CN110348767A 公开(公告)日: 2019-10-18
发明(设计)人: 王辉;史文竞;王龙;朱传坤;潘正军;常国亮;吴楠;丁怀宇 申请(专利权)人: 淮阴师范学院
主分类号: G06Q10/06 分类号: G06Q10/06;G06Q50/02;A01K61/59
代理公司: 南京业腾知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 32321 代理人: 董存壁
地址: 223300 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要:
搜索关键词: 子群组 常规育种 雌雄亲本 基础群体 日本沼虾 育种 结构化 交配 世代 家系 亲本 预测 后代 技术困难 近交系数 时间成本 遗传贡献 育种目标 基础群 群组 相等 遗传 衰退 组建
【说明书】:

发明公开一种日本沼虾常规育种中预测和避免近交程度的方法,包括以下步骤:1)根据育种目标,将组建的育种基础群体分为若干相等的子群组,即育种基础群体的结构化,设子群组的数目为c;2)亲本的交配设计:采用步骤1)中不同子群组中的雌雄亲本之间进行交配;3)每个世代近交对最大近交系数预测:假设每个世代每个群组中只有一对雌雄亲本产生后代,本发明将育种基础群结构化,建立子群组而不是家系,可避免因建立家系带来的巨大技术困难,节省经济和时间成本,具有很强可实际操作性。通过本发明所述方法,可以直接利用子群组的数量而不是利用对后代有遗传贡献的亲本的数量来控制每个世代的近交程度,克服了由近交导致的遗传衰退。

技术领域

本发明涉及一种日本沼虾常规育种中预测和避免近交程度的新方法。

背景技术

水产经济动物的育种技术和方法是提高养殖品种生产性能的最重要手段。目前国内外最普遍采用的常规育种方法之一是个体选择(individual selection)。该方法完全是基于基础群体中个体的表型值进行的选择。由于该方法在实际操作时具有简单易行、不需要个体标记或识别、不需要保持个体系统记录、经济成本低廉等优点,该方法已成为日本沼虾育种中采用的最主要育种策略。如果育种目标性状的遗传力较高,那么原则上可以快速取得遗传进展;该方法适合于生长率、形态性状(易于评估且在两性中都表达的性状);然而该方法也存在明显的缺点,即难以避免近交。

家系选择(family selection)也是一种有效的育种方法,该方法利用雌雄亲本单对交配技术建立若干家系并在此基础上根据育种目标性状的家系均值进行选择;为取得较为理想的选择反应,一般需要建立家系50个以上。由于在日本沼虾中难以进行人工受精、雌雄亲本间交配不同步,建立家系的技术难度极大且难以维持,成本也极高,因此家系选择策略目前在日本沼虾中未有实行,在其它水产经济动物中也较少采用,现有技术在日本沼虾常规育种中,存在着难以估计和控制近交程度的问题。

发明内容

发明目的:本发明目的在于针对现有技术的不足,提供一种日本沼虾常规育种中预测和避免近交程度的方法。

技术方案:本发明所述一种日本沼虾常规育种中预测和避免近交程度的方法,包括以下步骤:1)根据育种目标,将组建的育种基础群体分为若干相等的子群组,即育种基础群体的结构化,设子群组的数目为c;

2)亲本的交配设计:采用步骤1)中不同子群组中的雌雄亲本之间进行交配;

3)每个世代近交对最大近交系数预测:假设每个世代每个群组中只有一对雌雄亲本产生后代,根据近交系数的计算公式:

公式(1)中,F为近交系数,f和m分别为每个世代中产生后代的雌性亲本和雄性亲本的数量;随着育种的逐代进行,在选择进行到世代t时,近交系数Ft由下式计算:

Ft=1-(1-F)t (2)

根据公式(1)得出,每个世代每个群组中只有一对雌雄亲本产生后代时,f=m=c,则有:

其中,c为每个世代参加繁殖时子群组的数量,当育种进行到世代t时,根据公式(2)得近交系数为:

公式(4)是在每个世代中亲本数量最小,即只有一对亲本雌雄繁殖产生后代时得到的,因此,公式(4)计算得到的近交系数为每个世代的最大近交系数。

优选地,所述公式(4)用于预测t世代时的近交系数是最大近交系数,直接用子群组的数量预测近交系数,最大近交系数直接对群体近交程度进行预测。

有益效果:

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