[发明专利]延边黄牛肉质相关的FABP4基因SNP分子标记、引物对、试剂盒及其应用有效
申请号: | 201910764085.3 | 申请日: | 2019-08-19 |
公开(公告)号: | CN110438243B | 公开(公告)日: | 2022-11-29 |
发明(设计)人: | 夏广军;徐红艳;徐畅;邵静;尹宝珍 | 申请(专利权)人: | 延边大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 北京高沃律师事务所 11569 | 代理人: | 董大媛 |
地址: | 133000 吉林省延*** | 国省代码: | 吉林;22 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 延边 黄牛 肉质 相关 fabp4 基因 snp 分子 标记 引物 试剂盒 及其 应用 | ||
1.一种延边黄牛肉质相关的FABP4基因SNP分子标记,其特征在于,是SEQ ID No .1所示的核苷酸序列第138位多态性为A/C位点,第175位的多态性为A/T位点、第353位多态性为G/C位点,第387位的多态性为T/C位点和第409位的多态性为T/C位点。
2.权利要求1所述的延边黄牛肉质相关的FABP4基因SNP分子标记、用于扩增权利要求1所述延边黄牛肉质相关的FABP4基因SNP分子标记的引物对或包含所述引物对的试剂盒在辅助筛选延边黄牛育肥牛中的应用,所述引物对包括上游引物和下游引物,所述上游引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No .2所示;所述下游引物的核苷酸序列如序列表中SEQID No .3所示。
3.根据权利要求2所述应用,其特征在于,所述试剂盒还包括2×Taq PCR Mastermix。
4.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述筛选延边黄牛育肥牛的方法,包括以下步骤:
1)以延边黄牛的血液为样本提取基因组DNA;
2)以步骤1)中提取的基因组DNA为模板,用引物对进行普通PCR扩增,得到扩增产物;
3)将步骤2)中扩增产物进行测序,得到片段序列;
4)根据所述片段序列中FABP4基因的多态性确定具体基因型;
5)根据不同种类的基因型判断延边黄牛育肥牛的指标:
当基因型为杂合基因型时,选择脂肪含量和大理石花纹等级作为筛选检测指标;
所述引物对包括上游引物和下游引物,所述上游引物的核苷酸序列如序列表中SEQ IDNo .2所示;所述下游引物的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No .3所示。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,步骤2)中普通PCR扩增的反应程序:95℃预变性5min;94℃变性30s,55℃退火30s,72℃延伸30s,30个循环;72℃延伸10min。
6.根据权利要求4或5所述的应用,其特征在于,步骤2)中普通PCR扩增的反应体系:2×TaqPCR Mastermix 10μL,10μmol/L上游引物0 .5μL,10μmol/L下游引物0 .5μL,DNA模板2μL,ddH2O补充至20μl。
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