[发明专利]用于水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合及其应用有效
申请号: | 201910764158.9 | 申请日: | 2019-08-19 |
公开(公告)号: | CN110527736B | 公开(公告)日: | 2022-09-27 |
发明(设计)人: | 徐建龙;王文生;朱亚军;陈凯;申聪聪;赵秀琴 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院作物科学研究所;中国农业科学院深圳农业基因组研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 黄爽 |
地址: | 100081 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 用于 水稻 种质 资源 品种 鉴定 snp 标记 组合 及其 应用 | ||
1.用于扩增水稻种质资源和品种鉴定的核心SNP标记组合的引物组,其特征在于,用于水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合由70个SNP标记组成,70个SNP标记的编号分别为CoreLoci_001~CoreLoci_070,它们的信息如表1所示;其中,标记CoreLoci_001含有位于水稻基因组1号染色体第609506处的多态性为T/G的核苷酸序列,其余标记以此类推;
所述引物组的信息如表2所示;
所述水稻基因组的版本号:MSU Rice Genome Annotation Project- Release 7。
2.用于扩增水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合的引物组,其特征在于,用于水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合由200个SNP标记组成,其中70个为核心SNP标记,所述70个核心SNP标记的编号分别为CoreLoci_001~CoreLoci_070,它们的信息如表1所示;其中,标记CoreLoci_001含有位于水稻基因组1号染色体第609506处的多态性为T/G的核苷酸序列,其余标记以此类推;130个为扩展SNP标记;所述130个扩展SNP标记的编号分别为ExtendedLoci_001~ExtendedLoci_130,它们的信息如表3所示;其中,标记ExtendedLoci_001含有位于水稻基因组1号染色体第1409190处的多态性为C/T的核苷酸序列,其余标记以此类推;
所述70个核心SNP标记的引物组的信息如表2所示,所述130个扩展SNP标记的引物组的信息如表4所示;
所述水稻基因组的版本号:MSU Rice Genome Annotation Project- Release 7。
3.含有权利要求1或2所述引物组的检测试剂盒。
4.权利要求1或2所述引物组在制备水稻全基因组育种芯片中的应用。
5.权利要求1或2所述引物组的以下任一应用:
(1)用于水稻种质资源和品种鉴定及辅助育种;
(2)用于水稻DNA指纹图谱构建。
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