[发明专利]用于水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合及其应用有效

专利信息
申请号: 201910764158.9 申请日: 2019-08-19
公开(公告)号: CN110527736B 公开(公告)日: 2022-09-27
发明(设计)人: 徐建龙;王文生;朱亚军;陈凯;申聪聪;赵秀琴 申请(专利权)人: 中国农业科学院作物科学研究所;中国农业科学院深圳农业基因组研究所
主分类号: C12Q1/6895 分类号: C12Q1/6895;C12N15/11
代理公司: 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 代理人: 黄爽
地址: 100081 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: 用于 水稻 种质 资源 品种 鉴定 snp 标记 组合 及其 应用
【权利要求书】:

1.用于扩增水稻种质资源和品种鉴定的核心SNP标记组合的引物组,其特征在于,用于水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合由70个SNP标记组成,70个SNP标记的编号分别为CoreLoci_001~CoreLoci_070,它们的信息如表1所示;其中,标记CoreLoci_001含有位于水稻基因组1号染色体第609506处的多态性为T/G的核苷酸序列,其余标记以此类推;

所述引物组的信息如表2所示;

所述水稻基因组的版本号:MSU Rice Genome Annotation Project- Release 7。

2.用于扩增水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合的引物组,其特征在于,用于水稻种质资源和品种鉴定的SNP标记组合由200个SNP标记组成,其中70个为核心SNP标记,所述70个核心SNP标记的编号分别为CoreLoci_001~CoreLoci_070,它们的信息如表1所示;其中,标记CoreLoci_001含有位于水稻基因组1号染色体第609506处的多态性为T/G的核苷酸序列,其余标记以此类推;130个为扩展SNP标记;所述130个扩展SNP标记的编号分别为ExtendedLoci_001~ExtendedLoci_130,它们的信息如表3所示;其中,标记ExtendedLoci_001含有位于水稻基因组1号染色体第1409190处的多态性为C/T的核苷酸序列,其余标记以此类推;

所述70个核心SNP标记的引物组的信息如表2所示,所述130个扩展SNP标记的引物组的信息如表4所示;

所述水稻基因组的版本号:MSU Rice Genome Annotation Project- Release 7。

3.含有权利要求1或2所述引物组的检测试剂盒。

4.权利要求1或2所述引物组在制备水稻全基因组育种芯片中的应用。

5.权利要求1或2所述引物组的以下任一应用:

(1)用于水稻种质资源和品种鉴定及辅助育种;

(2)用于水稻DNA指纹图谱构建。

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