[发明专利]扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因及其编码蛋白和克隆方法在审
申请号: | 201910784372.0 | 申请日: | 2019-08-23 |
公开(公告)号: | CN110607316A | 公开(公告)日: | 2019-12-24 |
发明(设计)人: | 袁惠君;李虎军;鲍婧婷;王春梅;何芳兰;马倩国;高泽;李学勇 | 申请(专利权)人: | 兰州理工大学 |
主分类号: | C12N15/60 | 分类号: | C12N15/60;C12N15/10;C12N9/88;C12Q1/6851;C12Q1/6895;A01H5/00 |
代理公司: | 11279 北京中誉威圣知识产权代理有限公司 | 代理人: | 贾慧娜 |
地址: | 730050 甘肃*** | 国省代码: | 甘肃;62 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因转录 逆境胁迫 渗透胁迫 盐胁迫 丰度 实时荧光定量PCR 非生物逆境胁迫 植物遗传转化 核苷酸序列 氨基酸序 高盐条件 核苷酸序 基因编码 相关基因 植物抗逆 酶基因 脱羰基 枸杞叶 响应 抗性 可用 枸杞 验证 改良 干旱 基因 应用 分析 研究 | ||
1.扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因,其特征在于:所述与逆境胁迫响应相关基因为醛脱羰基酶基因LbCER1;作为优选,所述LbCER1基因的核苷酸序列为SEQ ID NO.1;或,与SEQ ID NO.1所示核苷酸序列相似性在90%以上的基因。
2.根据权利要求1所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因,其特征在于:所述醛脱羰基酶基因LbCER1编码的氨基酸序列如SEQ ID NO.2。
3.权利要求1或2所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因的克隆方法,其特征在于:包括如下步骤:幼苗培养,叶总RNA提取及反转录合成第一链cDNA,设计核心片段的引物,以上述cDNA为模板,通过PCR扩增得到核心片段产物,将产物回收后克隆入T载体,转化至感受态细胞诱导表达,筛选阳性克隆并测序,得到核心片段序列;再由5’-RACE法和3’-RACE法克隆得到5’和3’片段序列;通过序列拼接得到醛脱羰基酶基因LbCER1基因的核苷酸序列;
作为优选,所述感受态细胞为大肠杆菌DH5α。
4.根据权利要求3所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因的克隆方法,其特征在于:所述幼苗培养方法包括以下步骤:3周龄扁果枸杞幼苗用含有80mmol/L D-山梨醇的1/2Hoagland营养液渗透处理24h。
5.根据权利要求3所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因的克隆方法,其特征在于:所述核心片段产物制备方法为:以序列为5’-CATCAYCAYTCWATTGYWACWGARCC-3’的P1引物为上游引物,以序列为5’-CAACWGCYARDCTRCTTCCRTCYACC-3’的引物P2为下游引物,PCR程序为94℃预变性3min;94℃变性30s,54.5℃退火30s,72℃延伸90s,30个循环;72℃延伸10min;
其中,P1引物中,Y,W,R为简并引物,Y为C/T,W为A/T,R为A/G。
P2引物中,W,Y,R,D为简并引物,W为A/T,Y为C/T,R为A/G,D为A/G/T。
6.根据权利要求3所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因的克隆方法,其特征在于:所述RACE法克隆5’端时,以序列为5'-GATTACGCCAAGCTTAGCTGCTTCCGTCTACCACCTTCA-3'的引物GSP1为上游引物,以序列为5'-GATTACGCCAAGCTTAGCATCAGGCACTTCAGCTTCCC-3'的引物NGSP1为巢式下游引物。
7.根据权利要求3所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因的克隆方法,其特征在于:所述RACE法克隆3’端时,以序列为5'-GATTACGCCAAGCTTCCTTGGCCTCGGAGCCTCACACCT-3'的引物GSP2为上游引物,以序列为5'-GATTACGCCAAGCTTAGCTGAGTGAGGTGGTAGACGG-3'的引物NGSP2为巢式下游引物。
8.用qRT-PCR法分析权利要求1或2所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因转录丰度的方法,其特征在于:所述qRT-PCR反应体系中包括内参基因LbACT的上下游引物以及内参基因LbCER1基因的的上下游引物;所述内参基因LbACT的上游引物QA1序列为5’-CTATGAGTTGCCAGATGGACAG-3’,下游引物QA2序列为5’-TGGCTGGAAAAGGACTTCTG-3’;所述LbCER1基因的的上游引物QC1序列为5’-CACTGGGACTGCCTCTATGG-3’,下游引物QC2序列为5’-GTAGTGAGTGGTACGAGGGC-3’;所述qRT-PCR反应的程序为95℃预变性30s,95℃变性5s,60℃退火30s,72℃10s,40个循环。
9.权利要求1或2所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因在渗透胁迫、盐胁迫下转录丰度提高。
10.权利要求1或2所述的扁果枸杞中与逆境胁迫响应相关基因在制备抗逆、抗盐胁迫或抗旱的转基因植物中的应用。
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