[发明专利]孤独症诊断试剂盒、基因芯片、基因靶点筛选方法及应用

说明书

本发明实施例提供了一种孤独症诊断试剂盒、基因芯片、基因靶点筛选方法以及HLA‑B基因的错义突变p.A93G、HLA‑DQB1基因的错义突变p.S229N以及LILRB2基因的错义突变p.R322H以及剪接突变c.956‑4CT在孤独症基因诊断产品中的应用。相对于现有的全外显子/全基因组检测，其所需要的检测成本和数据处理难度都有了大幅度的下降，可以很好的应用于ASD的临床遗传学评估，对于ASD的防控具有一定的临床价值。

技术领域

本发明涉及ASD诊断技术领域，特别是涉及一种孤独症诊断试剂盒、基因芯片、基因靶点筛选方法及应用。

背景技术

孤独症谱系障碍(ASD，Autism Spectrum Disorders)是一组影响终生的神经系统发育障碍。其影响着超过1％的学龄期儿童，给普通家庭和整个社会造成了严重的经济和社会负担。

早期的证据表明免疫系统的失调与ASD相关，孕期感染/孕期免疫激活(maternalimmune activation,MIA)是ASD的一个环境风险因子。另有文献显示MIA小鼠后代常表现出ASD样行为，是目前比较成功的ASD小鼠模型，Choi等研究发现MIA诱导的ASD样行为依赖于Th17细胞和母体IL-17a，通过阻断IL-17a可改善MIA小鼠后代的行为异常；越来越多的证据表明ASD患者存在血清细胞因子异常，Tsilioni等发现血清IL-6和TNF可以定义ASD亚组，其从天然类黄酮木犀草素的治疗中获益最多，Al-Ayadhi等对45名6-12岁自闭症儿童进行的横断面研究显示，IL-17A与自闭症严重程度呈正相关，近50％的自闭症儿童血清IL-17A水平升高，其中67.9％为重度儿童，17％为轻度至中度ASD儿童。

目前为止，对于ASD尚缺乏有效的实验室诊断方法。考虑到ASD有很强的遗传背景，可以尝试使用ASD临床遗传学评估的方法。

但是，ASD有很高的遗传异质性，单个变异对ASD的解释度极小，所以在进行ASD临床遗传学评估时候，需要采用染色体芯片结合全外显子组/全基因组测序方法来实现。这样的方式成本较高，数据量极大对于数据解读有相当的难度，对于ASD患者的临床遗传学评估的开展和推广造成了许多限制。

因此，迫切需要提供方便快捷，成本低廉的基因检测技术，用以辅助进行ASD的诊断。

发明内容

本发明实施例提供一种孤独症诊断试剂盒、基因芯片、基因靶点筛选方法及应用，旨在解决现有ASD诊断方法所存在的一种或者多种问题。

第一方面，本发明实施例提供了HLA-B基因的错义突变p.A93G、HLA-DQB1基因的错义突变p.S229N以及LILRB2基因的错义突变p.R322H以及剪接突变c.956-4CT在孤独症基因诊断产品中的应用。

第二方面，本发明实施例提供了一种孤独症诊断试剂盒。所述试剂盒包括：用于检测待测样品中的HLA-B基因、HLA-DQB1基因以及LILRB2基因的若干种试剂。

可选地，所述试剂包括：用于对所述HLA-B基因、HLA-DQB1基因以及LILRB2基因的一个或者多个突变位点进行特异性扩增的PCR引物。

可选地，所述HLA-B基因的突变位点为错义突变p.A93G；所述HLA-DQB1基因的突变位点为错义突变p.S229N；所述LILRB2基因的突变位点为错义突变p.R322H以及剪接突变c.956-4CT。

第三方面，本发明实施例提供了一种用于孤独症诊断的基因芯片。所述基因芯片包括用于检测HLA-B基因、HLA-DQB1基因以及LILRB2基因中的一个或者多个突变位点的基因探针。

可选地，所述基因探针包括用于检测所述HLA-B基因的错义突变p.A93G，用于检测所述HLA-DQB1基因的错义突变p.S229N以及用于检测LILRB2基因的错义突变p.R322H和剪接突变c.956-4CT的探针。