[发明专利]甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点、SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点，位于甘蓝型油菜的A08染色体的第8024751位碱基～第11299788位碱基之间。较佳地，对甘蓝型油菜种子油酸含量的贡献率为71.00％。与第一SNP分子标记紧密连锁，第一SNP分子标记位于第8024751位碱基，为C或G，该突变导致多态性。与第二SNP分子标记紧密连锁，第二SNP分子标记位于第11299788位碱基，为A或G，该突变导致多态性。与峰值SNP分子标记紧密连锁，峰值SNP分子标记位于第10445600位碱基，为A或G，该突变导致多态性。还提供了相关的SNP分子标记及应用。本发明的甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点对甘蓝型油菜种子油酸含量的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。

技术领域

本发明涉及分子生物学及油菜育种技术领域，特别涉及甘蓝型油菜种子油酸含量技术领域，具体涉及甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点紧密连锁的SNP分子标记及应用。

背景技术

油菜(Brassica napus)是十字花科芸薹属植物中的一种重要的油料作物，是世界范围内广泛种植的主要油料作物，也是我国唯一的冬季油料作物。因此国家把发展油菜生产作为保证食用油安全供应的重点，具有重要的现实意义。我国甘蓝型油菜由于具有抗病、产量高、适应性广、耐逆行性强等特点，成为主要栽培品种。油菜增产主要通过期高单位面积菜籽产量、期高菜籽含油量和扩大种植面积三种途径。油菜育种工作者现在的主要目标是努力期高含油量、产量和品质。由于油菜的含油量、产量、品质等性状为复杂的数量性状，受环境的影响较大，依靠传统的育种方法和技术在现有的基础上很难有较大的突破，因此将数量遗传学和分子标记技术相结合，为油菜遗传育种的发展期供了新的机会。

基于SNP的分子标记技术被认为是继RFLP和SSR之后出现的第三代分子标记，是指同一位点的不同等位基因之间个别核苷酸的差异或只有小的缺失、突变、插入等，通过基于测序或PCR的DNA芯片技术等方法可以实现自动化批量检测，因而在基因定位的研究中有着不可比拟的优越性和潜力。

油菜中油酸和亚麻酸的含量对食用品质、营养品质、存储等方面有着重要的影响。从食用品质方面考虑，高油酸含量的菜籽油中多不饱和脂肪酸含量相对较低，热稳定性强，纯化加热过程中不容易被氧化，而亚麻酸在高温或强光照条件下容易被氧化导致油脂变质，不利于储存。从营养品质方面考虑，菜籽油中油酸(C18：1)等单不饱和脂肪酸更有益人体健康，而亚麻酸(C18：3)含有三个不饱和键，极易氧化形成自由基，出现脂质过氧化反应，损伤细胞与细胞膜的结构和功能。

现有技术中，江建霞等(上海农业学报，2019)指出，综合考虑菜籽油中油酸和亚麻酸含量对人体健康和储存方面的影响，提高菜籽油中油酸含量，降低亚麻酸含量是油菜品质育种中的一个重要育种目标。近年来，随着全基因组测序的完成，分子标记技术的广泛应用，分子标记辅助选择(MAS)技术的不断发展，油菜的油酸含量等重要品质性状相关的分子标记和QTL定位的研究成果越来越多，但多数为初步定位阶段。因此，借助分子标记和数量性状位点(QTL)定位，在分子水平对甘蓝型油菜种子油酸含量性状进行进一步研究，将有助于提高菜籽油品质，同时为揭示甘蓝型油菜中油酸含量遗传机理和分子机制奠定基础。

发明内容

为了解决上述现有技术中存在的问题，本发明的一个目的在于提供一种甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点的SNP分子标记，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点位于甘蓝型油菜的A08染色体的第8024751位碱基～第11299788位碱基之间，对甘蓝型油菜种子油酸含量的贡献率高，对甘蓝型油菜种子油酸含量的调控起着关键作用，可用作图位克隆和分子标记辅助选择，适于大规模推广应用。

优选地，所述的甘蓝型油菜种子油酸含量的主效QTL位点与SNP分子标记紧密连锁，所述SNP分子标记为第一SNP分子标记、第二SNP分子标记和/或峰值SNP分子标记。