[发明专利]一种结直肠癌的检测标志物及其应用

说明书

本发明公开了一种结直肠癌的检测标志物及其应用，具体的检测标志物为RP5‑1120P11.1、AC073283.4，本发明首次发现了RP5‑1120P11.1在结直肠癌患者中表达上调，AC073283.4在结直肠癌患者中表达下调，通过检测RP5‑1120P11.1或AC073283.4的表达水平，可以判断受试者是否患有结直肠癌。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及一种结直肠癌的检测标志物及其应用。

背景技术

结直肠癌(colorectal cancer,CRC)是全球第三大最常见的肿瘤。每年约有120万新发病例和60万患者死亡，结直肠癌也是致死率第四大最常见的肿瘤(Ferlay J,Soeromataram I,Dikshit R et al.Cancer incidence and mortality worldwide:sources,methods and major patterns in GLOBOCAN 2012.International journal ofcancer Journal international du cancer 2015；136(5):E359-386.)。发病率在50岁以下人群中较低，但随着年龄增加而显著提高。CRC的最重要预后因素是病人确诊时疾病所处阶段。之前的大量研究已经发现，结直肠癌家族史、炎症性肠道疾病、吸烟、过度饮酒等不良生活方式以及肥胖、糖尿病等疾病状态均可能促进结直肠癌的发生。健康的生活方式，如不吸烟不饮酒，合理膳食等是结直肠癌防控的重要手段。

结直肠癌的发病往往历经超过10年，而发育异常的腺瘤则是最常见的癌前病变。在散发性结直肠癌发病机制中，经典的“腺瘤一癌变”途径中，伴随着一连串基因突变的产生(APC,KRAS,TP53)(Fearon ER.Molecular genetics of colorectal cancer.Annualreview of pathology 2011；6:479-507.)。过去的几十年里，研究者们对CRC发病过程中蛋白编码基因的功能进行了深入细致的研究。然而，只有1％的人类基因组编码蛋白质，有70％至90％的基因组，可以在发育过程中某些时间点进行转录，产生大量的非编码RNA转录本(non-coding RNA，ncRNA)。近年来，随着科学技术的提高，高通量测序的普及，众多研究者们意识到大量转录过程的“暗物质”(dark matter)-非编码RNA同样广泛参与各种生命过程的调控，并发挥重要功能(Ponting CP,Belgard TG.Transcribed dark matter:meaningor myth？Human molecular genetics 2010；19(R2):R162-168.)。

高通量测序结果显示，人类基因组约93％的DNA可被转录为RNA，而其中仅有1-2％最终被翻译成蛋白质，其余的98％均为ncRNA，其编码功能极低或根本无编码功能。在这些转录本中，除microRNA(miRNA)，tRNA，rRNA为人们所熟知外，根据ncRNA的长度，一般少于200个核苷酸的ncRNA被称为小非编码RNA(small non-coding RNA)，而200～100,000个核苷酸的ncRNA被称为长链非编码RNA(long non-coding RNA，lncRNA)。在所有ncRNA中，1ncRNA占80％以上，且多由RNA聚合酶II转录形成。lncRNA具有一定的组织特异性，转录水平一般低于编码蛋白质的基因。lncRNA可参与众多生命过程的调节，包括染色质修饰、转录调控、表观遗传、转录后加工、入核转运等过程，而且能以细胞微结构原件、小RNA前体等形式发挥功能。

近年来，由于众多新方法的涌现，如全基因组关联研究，LncRNA芯片，RIP-RNA测序以及基因过表达和敲除/敲降，LncRNAs在癌症中的功能逐步被研究者们阐明。越来越多的证据表明，LncRNAs在多种组织中癌变，侵袭和转移过程中发挥重要功能。研究与CRC相关的lncRNA，对于揭示CRC的发病机制，实现CRC的早期诊断和治疗具有重要的意义。

发明内容