[发明专利]血浆DNA文库及其构建方法在审
申请号: | 201910810742.3 | 申请日: | 2019-08-29 |
公开(公告)号: | CN110468180A | 公开(公告)日: | 2019-11-19 |
发明(设计)人: | 王建伟;孙广欣;王冬;伍启熹;张静波;石露;王伟伟;刘倩;唐宇 | 申请(专利权)人: | 北京优迅医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C40B50/06 |
代理公司: | 11240 北京康信知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 路秀丽<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 100195 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 血浆 血浆DNA 构建 文库 接头连接 连接产物 末端修复 建库 乳化 修复 乳化预处理 文库构建 整体实验 游离DNA 乳化剂 省略 | ||
1.一种血浆DNA文库的构建方法,其特征在于,所述构建方法包括:
向所述血浆中加入乳化剂,得到乳化血浆;
对所述乳化血浆进行末端修复加“A”,得到修复血浆;
对所述修复血浆进行接头连接,得到连接产物;
对所述连接产物进行PCR扩增,得到所述血浆DNA文库。
2.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,所述血浆的用量为45~195μL,优选为50~180μL,更优选为100~150μL;
所述乳化剂选自Tween 20、Triton-100或NP40;优选地,所述乳化剂为Tween 20,更优选所述Tween 20在所述乳化血浆中的体积浓度为0.5%~10%,进一步优选为2%。
3.根据权利要求1所述的构建方法,其特征在于,采用同时具有末端修复和加“A”功能的Taq酶对所述乳化血浆进行末端修复加“A”,得到所述修复血浆;
优选地,所述同时具有末端修复和加“A”功能的Taq酶选自LA Taq或rTaq。
4.根据权利要求3所述的构建方法,其特征在于,所述末端修复加“A”的反应温度为50℃~75℃,优选为60℃~68℃;更优选为65℃。
5.根据权利要求1至4中任一项所述的构建方法,其特征在于,在对所述连接产物进行PCR扩增之前,所述构建方法还包括对所述连接产物进行纯化。
6.根据权利要求5所述的构建方法,其特征在于,对所述连接产物进行纯化包括:
对所述连接产物中的蛋白进行降解处理,得到第一纯化产物;
对所述第一纯化产物进行磁珠纯化,得到第二纯化产物,所述第二纯化产物即为纯化后的所述连接产物。
7.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于,采用蛋白降解剂对所述连接产物中的蛋白进行所述降解处理,得到所述第一纯化产物;
优选地,所述蛋白降解剂选自SDS和/或蛋白酶K;
更优选地,以质量体积浓度计,所述SDS在所述降解处理中的终浓度为0.5%~3%;
更优选地,所述蛋白酶K在所述降解处理中的终浓度为1mg/mL~4mg/mL。
8.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于,所述降解处理的温度为25℃~75℃,优选为45~65℃;
优选地,所述降解处理在震荡条件下进行,所述震荡的转速为600~1000rpm/min,更优选为750~850rpm/min;
优选地,所述降解处理的时间为5~20min。
9.根据权利要求6所述的构建方法,其特征在于,采用0.6~0.8倍所述第一纯化产物体积的Ampure XP磁珠对所述第一纯化产物进行纯化,得到所述第二纯化产物。
10.一种血浆DNA文库,其特征在于,所述血浆DNA文库通过权利要求1至9中任一项所述的构建方法构建而成。
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