[发明专利]xCas9n-epBE碱基编辑系统在基因编辑中的应用有效
申请号: | 201910812816.7 | 申请日: | 2019-08-30 |
公开(公告)号: | CN110577965B | 公开(公告)日: | 2022-12-20 |
发明(设计)人: | 杨进孝;徐雯;刘亚;王飞鹏;袁爽 | 申请(专利权)人: | 北京市农林科学院 |
主分类号: | C12N15/84 | 分类号: | C12N15/84;C12N15/90;C12N9/22;C07K19/00;A01H5/00;A01H6/46 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 关畅 |
地址: | 100097 北京市海淀区曙*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | xcas9n epbe 碱基 编辑 系统 基因 中的 应用 | ||
1.基因组靶点序列的编辑方法,为方法(一)或方法(二)或方法(三)或方法(四):
所述方法(一)包括如下步骤:将xCas9n的编码基因、转录tRNA-esgRNA的DNA分子、PmCDA1的编码基因和UGI的编码基因导入植物或植物细胞内,使所述xCas9n、所述tRNA-esgRNA、所述PmCDA1和所述UGI的编码基因均得到表达,实现基因组靶点序列的编辑;
所述方法(二)包括如下步骤:将xCas9n的编码基因、转录tRNA-esgRNA的DNA分子和PmCDA1的编码基因导入植物体或植物细胞内,使所述xCas9n、所述tRNA-esgRNA和所述PmCDA1的编码基因均得到表达,实现基因组靶点序列的编辑;
所述方法(三)包括如下步骤:将xCas9n、tRNA-esgRNA、PmCDA1和UGI导入植物或植物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;
所述方法(四)包括如下步骤:将xCas9n、tRNA-esgRNA和PmCDA1导入植物或植物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;
所述tRNA-esgRNA靶向所述靶点序列;
所述tRNA-esgRNA如式I所示:tRNA-所述靶点序列转录的RNA-esgRNA骨架(式I);
所述tRNA为将序列1第474-550位中的T替换为U得到的RNA分子;
所述esgRNA骨架为将序列1第571-656位中的T替换为U得到的RNA分子;
所述靶点序列的PAM序列为如下任一种:TGT、GGT、GAA、GAT;
所述xCas9n为氨基酸序列是序列2所示的蛋白质;
所述PmCDA1为氨基酸序列是序列3所示的蛋白质;
所述UGI为氨基酸序列是序列4所示的蛋白质。
2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述xCas9n的编码基因为序列1第2857-7125位所示的DNA分子。
3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述PmCDA1的编码基因为序列1第7417-8040位所示的DNA分子。
4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述UGI的编码基因为序列1第8062-8358位所示的DNA分子。
5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述基因组靶点序列的编辑为将所述靶点序列中的C突变为T。
6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述植物为p1)或p2)或p3):
p1)单子叶植物或双子叶植物;
p2)禾本科植物;
p3)水稻;
所述植物细胞为q1)或q2)或q3):
q1)单子叶植物细胞或双子叶植物细胞;
q2)禾本科植物细胞;
q3)水稻细胞。
7.植物突变体的制备方法,包括如下步骤:按照权利要求1-6任一所述的方法对植物的基因组靶点序列进行编辑,获得植物突变体。
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