[发明专利]xCas9n-epBE碱基编辑系统在基因编辑中的应用有效

专利信息
申请号: 201910812816.7 申请日: 2019-08-30
公开(公告)号: CN110577965B 公开(公告)日: 2022-12-20
发明(设计)人: 杨进孝;徐雯;刘亚;王飞鹏;袁爽 申请(专利权)人: 北京市农林科学院
主分类号: C12N15/84 分类号: C12N15/84;C12N15/90;C12N9/22;C07K19/00;A01H5/00;A01H6/46
代理公司: 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 代理人: 关畅
地址: 100097 北京市海淀区曙*** 国省代码: 北京;11
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摘要:
搜索关键词: xcas9n epbe 碱基 编辑 系统 基因 中的 应用
【权利要求书】:

1.基因组靶点序列的编辑方法,为方法(一)或方法(二)或方法(三)或方法(四):

所述方法(一)包括如下步骤:将xCas9n的编码基因、转录tRNA-esgRNA的DNA分子、PmCDA1的编码基因和UGI的编码基因导入植物或植物细胞内,使所述xCas9n、所述tRNA-esgRNA、所述PmCDA1和所述UGI的编码基因均得到表达,实现基因组靶点序列的编辑;

所述方法(二)包括如下步骤:将xCas9n的编码基因、转录tRNA-esgRNA的DNA分子和PmCDA1的编码基因导入植物体或植物细胞内,使所述xCas9n、所述tRNA-esgRNA和所述PmCDA1的编码基因均得到表达,实现基因组靶点序列的编辑;

所述方法(三)包括如下步骤:将xCas9n、tRNA-esgRNA、PmCDA1和UGI导入植物或植物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;

所述方法(四)包括如下步骤:将xCas9n、tRNA-esgRNA和PmCDA1导入植物或植物细胞内,实现基因组靶点序列的编辑;

所述tRNA-esgRNA靶向所述靶点序列;

所述tRNA-esgRNA如式I所示:tRNA-所述靶点序列转录的RNA-esgRNA骨架(式I);

所述tRNA为将序列1第474-550位中的T替换为U得到的RNA分子;

所述esgRNA骨架为将序列1第571-656位中的T替换为U得到的RNA分子;

所述靶点序列的PAM序列为如下任一种:TGT、GGT、GAA、GAT;

所述xCas9n为氨基酸序列是序列2所示的蛋白质;

所述PmCDA1为氨基酸序列是序列3所示的蛋白质;

所述UGI为氨基酸序列是序列4所示的蛋白质。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述xCas9n的编码基因为序列1第2857-7125位所示的DNA分子。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述PmCDA1的编码基因为序列1第7417-8040位所示的DNA分子。

4.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述UGI的编码基因为序列1第8062-8358位所示的DNA分子。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述基因组靶点序列的编辑为将所述靶点序列中的C突变为T。

6.根据权利要求1所述的方法,其特征在于:所述植物为p1)或p2)或p3):

p1)单子叶植物或双子叶植物;

p2)禾本科植物;

p3)水稻;

所述植物细胞为q1)或q2)或q3):

q1)单子叶植物细胞或双子叶植物细胞;

q2)禾本科植物细胞;

q3)水稻细胞。

7.植物突变体的制备方法,包括如下步骤:按照权利要求1-6任一所述的方法对植物的基因组靶点序列进行编辑,获得植物突变体。

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