[发明专利]利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法在审
申请号: | 201910815452.8 | 申请日: | 2019-08-30 |
公开(公告)号: | CN110511934A | 公开(公告)日: | 2019-11-29 |
发明(设计)人: | 崔佳;吴长新;赵仲华 | 申请(专利权)人: | 山西大学;长治医学院 |
主分类号: | C12N15/113 | 分类号: | C12N15/113;C12N15/90;C12Q1/6869;A01K67/027 |
代理公司: | 14115 太原申立德知识产权代理事务所(特殊普通合伙) | 代理人: | 程园园<国际申请>=<国际公布>=<进入 |
地址: | 030006*** | 国省代码: | 山西;14 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基因敲除 斑马鱼 突变体 基因 斑马鱼受精卵 斑马鱼品系 靶点位置 动物模型 技术构建 筛选培养 体外转录 突变类型 稳定遗传 靶位点 打靶区 高效率 敲除 遗传 研究 | ||
1.利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:包括如下步骤:
S1.在斑马鱼asap1a基因上选择asap1a-gRNA靶位点,分析确认asap1a-gRNA靶位点敲除特异性;
S2.制备asap1a-gRNA;
S3.将asap1a-gRNA和Cas9mRNA导入斑马鱼中制备F0代斑马鱼,并鉴定asap1a-gRNA靶位点打靶效率;
S4.鉴定F0代斑马鱼子代即F1代斑马鱼卵中asap1a基因类型,进而筛选出亲本F0代斑马鱼中可以遗传的asap1a敲除突变体;
S5.筛选F2代斑马鱼中asap1a基因敲除纯合突变体,培养获得稳定遗传的斑马鱼asap1a基因敲除突变体,即完成利用CRISPR/Cas9技术对斑马鱼asap1a基因敲除突变体的构建。
2.根据权利要求1所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S1中asap1a-gRNA靶位点序列为SEQ ID NO.1所示序列。
3.根据权利要求1所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S1中asap1a-gRNA靶位点位于斑马鱼asap1a基因第五个外显子上。
4.根据权利要求1所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S2中制备asap1a-gRNA的方法为:
S2.1将asap1a-gRNA靶位点的DNA序列连接入pDR274载体;
S2.2从重组的pDR274-asap1a-gRNA质粒中扩增T7promoter-asap1a-gRNA;
S2.3扩增的产物进行PCR产物回收并进行体外转录得到asap1a-gRNA。
5.根据权利要求4所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S2.1中将asap1a-gRNA靶位点的DNA序列连接入pDR274载体的引物序列为SEQ ID NO.2和SEQ ID NO.3所示序列。
6.根据权利要求4所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S2.2中扩增T7 promoter-asap1a-gRNA引物序列为SEQ IDNO.4和SEQ ID NO.5所示序列。
7.根据权利要求1所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S3将asap1a-gRNA和Cas9mRNA导入斑马鱼中制备F0代斑马鱼,并鉴定asap1a-gRNA靶位点打靶效率,具体为:
S3.1将体外转录获得的asap1a-gRNA与Cas9mRNA混合后通过显微注射导入斑马鱼受精卵,其中asap1a-gRNA终浓度为100ng/μL,Cas9 mRNA终浓度为300ng/μL,导入体积为:1nL/卵;
S3.2选取50粒已经导入asap1a-gRNA与Cas9mRNA的受精后24h的斑马鱼卵并混合提取鱼卵基因组,且以此混合基因组为模板扩增asap1a-gRNA靶位点上下游序列各约150bp,将扩增产物测序后与野生型斑马鱼DNA序列进行比对,计算设计的asap1a-gRNA靶位点敲除效率。
8.根据权利要求7所述的利用CRISPR/Cas9技术构建斑马鱼asap1a基因敲除突变体的方法,其特征在于:所述步骤S3.2中扩增asap1a-gRNA靶位点上下游序列各约150bp的引物为SEQ ID NO.6和SEQ ID NO.7所示序列。
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