[发明专利]用于测序文库的封闭试剂及提高靶向捕获效率的方法在审
申请号: | 201910818086.1 | 申请日: | 2019-08-30 |
公开(公告)号: | CN110564831A | 公开(公告)日: | 2019-12-13 |
发明(设计)人: | 刘运超;李伟伟;万华;方楠;伍启熹;王建伟;刘倩;唐宇 | 申请(专利权)人: | 北京优迅医学检验实验室有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C40B50/06 |
代理公司: | 11240 北京康信知识产权代理有限责任公司 | 代理人: | 梁文惠 |
地址: | 100195 北京市海淀区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 封闭 标签序列 通用序列 测序文库 封闭试剂 操作效率 互补序列 通用接头 通用 靶向 捕获 合成 应用 | ||
1.一种用于测序文库的封闭试剂,所述测序文库的接头包括接头通用序列和标签序列,其特征在于,所述封闭试剂包括通用封闭序列,所述通用封闭序列由用于封闭所述接头通用序列或所述接头通用序列的互补序列的核苷酸序列组成。
2.根据权利要求1所述的封闭试剂,其特征在于,所述通用封闭序列为经过修饰的DNA序列,所述修饰选自由锁核苷酸修饰、间臂修饰、随机碱基修饰、次黄嘌呤修饰、脱氧尿嘧啶修饰、MGB修饰、反向dT修饰、硫代修饰和磷酸化修饰中的一种或多种。
3.根据权利要求1所述的封闭试剂,其特征在于,所述通用封闭序列包括具有SEQ IDNO:1,SEQ ID NO:2,SEQ ID NO:3和SEQ ID NO:4所示的核苷酸序列。
4.根据权利要求1所述的封闭试剂,其特征在于,所述封闭试剂中通用封闭序列的浓度为0.1~0.4μM。
5.根据权利要求1所述的封闭试剂,其特征在于,所述封闭试剂还包括:Tris缓冲液,EDAT,人Cot-1 DNA和鲑鱼精DNA。
6.根据权利要求5所述的封闭试剂,其特征在于,所述封闭试剂中所述Tris缓冲液的浓度为0.1~10mM,EDAT的浓度为0.1~1mM,人Cot-1 DNA的浓度为0.1~2mg/ml,鲑鱼精DNA的浓度为1~10mg/ml。
7.根据权利要求1所述的封闭试剂,其特征在于,所述接头为illumina平台或华大测序仪平台二代测序的通用接头。
8.根据权利要求1所述的封闭试剂,其特征在于,所述通用封闭序列的长度小于所述接头通用序列,多个所述通用封闭序列通过拼接的形式对所述接头通用序列或所述接头通用序列的互补序列进行封闭。
9.一种提高靶向捕获效率的方法,其特征在于,包括以下步骤:
S1,获取DNA样本并构建测序文库,所述测序文库的接头包括接头通用序列和标签序列;
S2,采用如权利要求1至8中任一项所述的封闭试剂对所述接头通用序列进行封闭;以及
S3,采用捕获探针进行靶向捕获。
10.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,所述封闭的反应条件为95℃保温10min,65℃保温4~24小时。
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