[发明专利]检测CAH相关真假基因的方法有效
申请号: | 201910828750.0 | 申请日: | 2019-09-03 |
公开(公告)号: | CN112442530B | 公开(公告)日: | 2023-03-28 |
发明(设计)人: | 高贵丽;郎娜;高玉梅;汪德鹏 | 申请(专利权)人: | 北京希望组生物科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11;C12Q1/6869;G16B30/10 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司 11245 | 代理人: | 陆惠中;田欢 |
地址: | 102206 北京市昌平区*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 cah 相关 真假 基因 方法 | ||
1.一种引物组,其特征在于,所述引物组包括:第一引物对,其核苷酸序列
如SEQ ID NO:1和SEQ ID NO:2所示;第二引物对,其核苷酸序列如SEQ ID NO:3和SEQID NO:4所示。
2.一种PCR扩增体系,其特征在于,所述PCR扩增体系包括:用于扩增的缓 冲体系以及位于所述PCR扩增体系中的权利要求1所述的引物组。
3.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求1所述的引物组。
4.一种如权利要求3所述确定CAH相关基因的突变情况的试剂盒,其特征在于,试剂盒使用方法包括以下步骤:
S1:提取样品中DNA并使用权利要求1所述的引物组进行PCR扩增;
S2:用三代测序平台对扩增产物进行检测;
S3:对测序结果进行分析得到CAH相关基因的突变情况。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,在S1中,每个样品上标记特异 的barcode序列。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,在S2中,包括以下步骤:
(1)使用建库试剂盒进行建库;
(2)进行接头连接PCR反应;
(3)纯化处理后上机测序。
7.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,在S3中,测序结果分析包括以 下步骤:首先进行下机数据处理,然后进行生物信息学分析。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述生物信息学分析包括以下
步骤:
1)将测序序列与参考序列比对;
2)基于参考序列开发标签;
3)对测序序列基于标签构建数组、排序并分组;
4)确定基因型;
5)变异分析。
9.权利要求1所述的引物组、权利要求2所述的PCR扩增体系或权利要求3-8任一项所述的试剂盒在CAH领域中的应用,所述应用属于非诊断和治疗疾病目的的。
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