[发明专利]一种与茶树咖啡碱含量连锁的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 201910834185.9 | 申请日: | 2019-09-04 |
公开(公告)号: | CN110408723B | 公开(公告)日: | 2020-09-08 |
发明(设计)人: | 吴华玲;方开星;李红建;姜晓辉;秦丹丹;王秋霜;潘晨东;李波;黄华林 | 申请(专利权)人: | 广东省农业科学院茶叶研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
代理公司: | 广州粤高专利商标代理有限公司 44102 | 代理人: | 段卉 |
地址: | 510640 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 茶树 咖啡碱 含量 连锁 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.一种茶树咖啡碱含量数量性状连锁的分子标记组合或其中的任意一个分子标记的引物在评价茶树咖啡碱含量中的应用,其特征在于,所述组合中的分子标记为SNP位点1和2:
其中,所述SNP位点1位于茶树基因组Scaffold115:803980,即SEQ ID NO:1所示核苷酸序列的第501个碱基,该位点为G或者为A,当样本基因型为双突变GG时,茶树中干物质中咖啡碱含量大概率低于基因型为野生型AA或单突变GA的样本;
所述SNP位点2位于茶树基因组Scaffold720:596655,即SEQ ID NO:4所示核苷酸序列的第501个碱基,该位点为T或者为C,当样本基因型为单突变CT时,茶树中干物质中咖啡碱含量大概率低于正常平均水平的CC型。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SNP位点1的引物的核苷酸序列如SEQID NO:2~3所示。
3.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述SNP位点2的引物的核苷酸序列如SEQID NO:5~6所示。
4.一种评价茶树咖啡碱含量的方法,其特征在于,检测权利要求1所述分子标记组合或其中的任意一个分子标记的基因型。
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