[发明专利]基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的分子标记、引物及方法有效

专利信息
申请号: 201910835831.3 申请日: 2019-09-05
公开(公告)号: CN110396552B 公开(公告)日: 2023-02-10
发明(设计)人: 黎睿君;黄宇希;高延奇 申请(专利权)人: 大连海洋大学;黎睿君
主分类号: C12Q1/6893 分类号: C12Q1/6893;C12Q1/686;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 大连非凡专利事务所 21220 代理人: 闪红霞
地址: 116000 辽宁*** 国省代码: 辽宁;21
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摘要:
搜索关键词: 基于 pcr 鉴定 水滴 伪康纤虫 分子 标记 引物 方法
【说明书】:

发明公开一种基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的分子标记,DNA序列如SEQ ID NO:1所示;上游引物及下游引物的DNA序列分别如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示;鉴定方法依次按照如下步骤进行:分离鱼体病灶部位组织提取组织DNA;进行PCR扩增;用琼脂糖凝胶电泳检验PCR产物,若出现498 bp的电泳条带,病灶部位寄生的盾纤毛虫即为水滴伪康纤虫,具有快速、简单和准确等优点。

技术领域

本发明属于生物技术领域,尤其是一种基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的分子标记、引物及方法。

背景技术

水滴伪康纤虫(Pseudocohnilembus persalinus)是盾纤毛虫的代表种,隶属于盾纤目,纤毛虫类,是个体微小的兼性寄生纤毛虫,已被公认为是海水养殖鱼类的主要盾纤类病原体。水滴伪康纤虫适应性极强,可自由生活于各种养殖水体中,一旦养殖水体中因残饵过多、环境恶化等导致有机物含量过高,水滴伪康纤虫将大量繁殖并寄生于各养殖周期鱼体,尤其是体表损伤的鱼体。该寄生虫以宿主的细胞或组织碎片为食,严重时患病鱼体继发细菌性疾病,导致养殖鱼类大量死亡。为此当虫害发生时,需要对寄生于宿主体表的虫子进行鉴定,以便根据不同种类准确施药。

然而,由于盾纤类寄生虫活体形态十分相似,在光学显微镜及扫描电镜下均难以区分(附图1、2、3、4),即使借助18S rDNA技术测定核糖体序列,因盾纤类的序列相似度相对较高(达到90%以上),使得盾纤毛虫定种难度较大。

发明内容

本发明是为了解决现有技术所存在的上述技术问题,提供一种基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的分子标记、引物及方法。

本发明的技术解决方案是:一种基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的分子标记,其特征在于DNA序列如SEQ ID NO:1所示。

一种基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的引物,其特征在于上游引物及下游引物的DNA序列分别如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示。

一种基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的方法,其特征在于依次按照如下步骤进行:

a. 取患病鱼体表盾纤毛虫寄生病灶部位组织提取DNA;

b. 按照下列条件进行PCR扩增:

PCR反应体系为40 μL体系:KOD buffer 20 μL, 2 mM dNTPs 8 μL,上游引物及下游引物各 2 μL,2 μL,KOD酶 0.8 μL,盾纤毛虫DNA 2 μL,灭菌蒸馏水5.2 μL;所述游引物及下游引物的DNA序列分别如SEQ ID NO:2、SEQ ID NO:3所示;

PCR反应条件为:94 ℃预变性3 min; 98 ℃变性15 s,56 ℃退火30 s,68 ℃延伸45 s,35个循环;68 ℃延伸5 min;

c. 用琼脂糖凝胶电泳检验PCR产物,若出现498 bp的电泳条带,所分离得到的盾纤毛虫即为水滴伪康纤虫。

本发明确定了基于PCR鉴定水滴伪康纤虫的分子标记并设计了鉴定引物,只需进行一次PCR扩增,即可准确地鉴定出盾纤毛虫的代表病原—水滴伪康纤虫,具有快速、简便及准确等优点。

附图说明

图1是水滴伪康纤虫在光学显微镜下观察结果。

图2是海洋尾丝虫在光学显微镜下观察结果。

图3是水滴伪康纤虫扫描电镜观察结果。

图4是海洋尾丝虫扫描电镜观察结果。

图5是本发明实施例以被测鱼体组织DNA为模板进行PCR扩增结果电泳图。

图6以海洋尾丝虫DNA和水滴伪康纤虫DNA为模板进行PCR扩增结果电泳图。

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