[发明专利]一种与猪总乳头数性状相关的分子标记及应用

说明书

本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪总乳头数性状相关的分子标记及应用。所述的分子标记可用于猪总乳头数性状的标记辅助选择。本发明通过基因芯片技术对该基因进行分型，筛选得到一种与猪总乳头数性状相关的分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示，或为图2所示的基因片段，在所述序列的第101位的碱基处存在一个A/G的等位基因突变，该突变导致所述分子标记的核苷酸序列产生多态性，且当所述序列第101bp处核苷酸为A时，判定猪具有更多的总乳头数性状。本发明为猪总乳头数性状的标记辅助选择提供了显著关联的SNP分子标记。

技术领域

本发明属于猪分子标记筛选技术领域，具体涉及一种与猪总乳头数性状相关的分子标记及应用。所述的分子标记可用于猪总乳头数性状的标记辅助选择。

背景技术

乳头数性状是影响母猪繁殖性能和仔猪生存的重要性状(Wang L,etal.Genotyping by sequencing reveals a new locus for pig teat number[J].Animalgenetics,2017,48(4):470-472.)。在传统的猪育种中，对性状的选择多集中于产仔数性状，如窝总产仔数、产活仔数、5天存活仔猪数和21天断奶仔猪数等。在过去的十几年中，传统的选育方法持续对产仔数进行高强度选择，已经使产仔数得到了显著增加。截止2013年，丹麦纯种大白的平均窝产仔数已达到14头(Nielsen B,et al.Selection for increasednumber of piglets at d 5after farrowing has increased litter size and reducedpiglet mortality[J].Journal of animal science,2013,91(6):2575-2582.)。然而，产仔数的提高并没有使乳头数得到相应的提高，乳头数的不足可能会影响仔猪的存活率和健康状况，因而有研究者提出，现阶段遗传改良应着力提升猪乳头数性状，以充分满足仔猪的营养需求(Chalkias H.Genetic and clinical studies of teat traits in the pig[M].2013.)。对美系大白猪总乳头数性状遗传参数估计的研究表明，该性状遗传力多在0.40～0.43之间，属于中等遗传力的性状。中等的遗传力表明通过选育对美系大白猪总乳头数性状进行改良具有较大的空间，可以得到比较理想的育种效果。随着高通量测序技术的不断发展，在家畜的全基因组范围内已经检测出大量的遗传标记，这使得以表型数据和基因型数据关联为基础的全基因组关联分析(Genomic wide association study,简称GWAS)在家畜经济性状、疾病抗性等复杂性状遗传研究中得到广泛的应用(王继英等，全基因组关联分析在畜禽中的研究进展[D],2013；尹建良等，猪全基因组关联分析研究进展及展望[J]，中国猪业,2017,12(10):32-36.；乔贤等，全基因组关联分析在畜禽重要经济性状中的研究进展[J].家畜生态学报,2017,38(10):1-9.；赵德胜等，家畜全基因组关联分析研究进展[J]，中国畜牧兽医,2018,45(02):463-470)。GWAS分析在全基因组范围内寻找与目标性状显著关联的SNP位点，并通过连锁不平衡分析进一步确定候选基因，为解析复杂数量性状的遗传基础提供了有效的分析手段。