[发明专利]一种RNA探针杂交捕获试剂及其制备方法有效

专利信息
申请号: 201910844858.9 申请日: 2019-09-07
公开(公告)号: CN110904190B 公开(公告)日: 2023-03-21
发明(设计)人: 王小清 申请(专利权)人: 上海瀚垚生物医学科技有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806
代理公司: 上海邦德专利代理事务所(普通合伙) 31312 代理人: 田强
地址: 201321 上海市浦东新*** 国省代码: 上海;31
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摘要:
搜索关键词: 一种 rna 探针 杂交 捕获 试剂 及其 制备 方法
【权利要求书】:

1.一种RNA探针杂交捕获试剂,其特征在于,所述RNA探针杂交捕获试剂中以Hybridbuffer为底物;采用Wash buffer1和Wash Buffer2进行漂洗;采用Binding Buffer重悬磁珠;

其中,所述Hybrid buffer包括10倍浓缩的SSPE,10倍浓缩的Dehard,10mM EDTA,5mMMgCl2,占总混合液浓度40%的盐酸葡聚糖,占总混合液浓度30%的DMF;

所述Wash buffer1包括1X SSC 12.5ml含0.1%SDS;

所述Wash Buffer2包括0.1X SSC含0.1%SDS;

所述Binding Buffer包括1M NaCl、10mM Tris-HCl和1mM EDTA。

2.一种RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,制备如权利要求1所述的RNA探针杂交捕获试剂,其特征在于,包括以下步骤:

一、杂交操作;

1.1:取浓缩干燥好的DNA文库用的DEPC处理水,补足至6ul,吹打混匀离心后加入排管中,标记为B列;

1.2:将Hybrid buffer置于室温下融化后,取10μL Hybrid Buffer加入新的排管中,标记为A列;

1.3:混合探针,并将所述探针加入排管中,标记为C列;

1.4:将所述B列排管置于PCR仪中,运行Capture程序,热盖初始温度调整为105℃,逐渐降低,在所述热盖95℃的环境下处理5min,直至所述热盖温度保持在65℃;

1.5:当所述热盖转入65摄氏度时,将离心过的A列排管和C列排管置于B列排管的两侧,盖紧所述热盖,预热处理5min;

1.6:预热结束后,吸取所述A列排管中试剂13μL加入至所述C列排管中,将所述B列排管中试剂全部加入至所述C列排管中,盖上新管盖;

1.7:盖上所述热盖,对所述C列排管内试剂进行杂交,杂交时间大于等于2h;

二、采用Binding Buffer重悬磁珠,将重悬的所述磁珠装入排管置于PCR仪内预热;

三、将所述磁珠置于所述C列排管中与所述探针混合;

四、将所述C列排管内混合液采用Wash buffer1进行洗涤;

五、将所述C列排管内混合液采用Wash buffer 2进行洗涤;

六、采用百分之80的乙醇对所述C列排管内混合液进行洗涤;

七、采用双蒸馏水对所述C列排管内混合液重悬磁珠,取重悬液进行PCR扩增,得到所述探针杂交捕获试剂。

3.根据权利要求2所述的RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,其特征在于,在步骤1.3中,所述混合探针包括2μL的V7全外显子探针和5μL的一倍浓缩的RNase Block。

4.根据权利要求2所述的RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,其特征在于,所述步骤二包括以下步骤:

2.1:以每个杂交反应捕获50μL的量取Dynabeads,加入至2ml EP管中,将所述EP管放入磁力架,待磁珠全部吸附至侧壁,弃尽管中液体;

2.2:取所述磁珠两倍体积的Binding Buffer重悬所述磁珠,再将所述EP管放入磁力架,待所述磁珠全部吸附至侧壁,弃尽管中液体;

2.3:重复上述步骤2.2,共漂洗3次;

2.4:取Binding buffer,按每个杂交反应捕获200μL的量重悬所述磁珠,将重悬的所述磁珠置于新的排管中;

2.5:将装有所述磁珠的排管置于PCR仪内,在65℃的环境下预热5min,热盖温度为105℃。

5.根据权利要求2所述的RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,其特征在于,所述步骤三包括:

3.1:将所述磁珠加入到所述C列排管中,盖上新管盖;

3.2:将加入所述磁珠的所述C列排管放入翻转混匀仪,以30转/min翻转混匀30min;

3.3:翻转混匀结束后,将所述C列排管放入磁力架上,室温下静置1min,待所述磁珠吸附至侧壁,弃尽上清。

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