[发明专利]一种RNA探针杂交捕获试剂及其制备方法有效
申请号: | 201910844858.9 | 申请日: | 2019-09-07 |
公开(公告)号: | CN110904190B | 公开(公告)日: | 2023-03-21 |
发明(设计)人: | 王小清 | 申请(专利权)人: | 上海瀚垚生物医学科技有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806 |
代理公司: | 上海邦德专利代理事务所(普通合伙) 31312 | 代理人: | 田强 |
地址: | 201321 上海市浦东新*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 rna 探针 杂交 捕获 试剂 及其 制备 方法 | ||
1.一种RNA探针杂交捕获试剂,其特征在于,所述RNA探针杂交捕获试剂中以Hybridbuffer为底物;采用Wash buffer1和Wash Buffer2进行漂洗;采用Binding Buffer重悬磁珠;
其中,所述Hybrid buffer包括10倍浓缩的SSPE,10倍浓缩的Dehard,10mM EDTA,5mMMgCl2,占总混合液浓度40%的盐酸葡聚糖,占总混合液浓度30%的DMF;
所述Wash buffer1包括1X SSC 12.5ml含0.1%SDS;
所述Wash Buffer2包括0.1X SSC含0.1%SDS;
所述Binding Buffer包括1M NaCl、10mM Tris-HCl和1mM EDTA。
2.一种RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,制备如权利要求1所述的RNA探针杂交捕获试剂,其特征在于,包括以下步骤:
一、杂交操作;
1.1:取浓缩干燥好的DNA文库用的DEPC处理水,补足至6ul,吹打混匀离心后加入排管中,标记为B列;
1.2:将Hybrid buffer置于室温下融化后,取10μL Hybrid Buffer加入新的排管中,标记为A列;
1.3:混合探针,并将所述探针加入排管中,标记为C列;
1.4:将所述B列排管置于PCR仪中,运行Capture程序,热盖初始温度调整为105℃,逐渐降低,在所述热盖95℃的环境下处理5min,直至所述热盖温度保持在65℃;
1.5:当所述热盖转入65摄氏度时,将离心过的A列排管和C列排管置于B列排管的两侧,盖紧所述热盖,预热处理5min;
1.6:预热结束后,吸取所述A列排管中试剂13μL加入至所述C列排管中,将所述B列排管中试剂全部加入至所述C列排管中,盖上新管盖;
1.7:盖上所述热盖,对所述C列排管内试剂进行杂交,杂交时间大于等于2h;
二、采用Binding Buffer重悬磁珠,将重悬的所述磁珠装入排管置于PCR仪内预热;
三、将所述磁珠置于所述C列排管中与所述探针混合;
四、将所述C列排管内混合液采用Wash buffer1进行洗涤;
五、将所述C列排管内混合液采用Wash buffer 2进行洗涤;
六、采用百分之80的乙醇对所述C列排管内混合液进行洗涤;
七、采用双蒸馏水对所述C列排管内混合液重悬磁珠,取重悬液进行PCR扩增,得到所述探针杂交捕获试剂。
3.根据权利要求2所述的RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,其特征在于,在步骤1.3中,所述混合探针包括2μL的V7全外显子探针和5μL的一倍浓缩的RNase Block。
4.根据权利要求2所述的RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,其特征在于,所述步骤二包括以下步骤:
2.1:以每个杂交反应捕获50μL的量取Dynabeads,加入至2ml EP管中,将所述EP管放入磁力架,待磁珠全部吸附至侧壁,弃尽管中液体;
2.2:取所述磁珠两倍体积的Binding Buffer重悬所述磁珠,再将所述EP管放入磁力架,待所述磁珠全部吸附至侧壁,弃尽管中液体;
2.3:重复上述步骤2.2,共漂洗3次;
2.4:取Binding buffer,按每个杂交反应捕获200μL的量重悬所述磁珠,将重悬的所述磁珠置于新的排管中;
2.5:将装有所述磁珠的排管置于PCR仪内,在65℃的环境下预热5min,热盖温度为105℃。
5.根据权利要求2所述的RNA探针杂交捕获试剂的制备方法,其特征在于,所述步骤三包括:
3.1:将所述磁珠加入到所述C列排管中,盖上新管盖;
3.2:将加入所述磁珠的所述C列排管放入翻转混匀仪,以30转/min翻转混匀30min;
3.3:翻转混匀结束后,将所述C列排管放入磁力架上,室温下静置1min,待所述磁珠吸附至侧壁,弃尽上清。
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