[发明专利]一种基于S100蛋白家族的急性胰腺炎严重程度预测模型及其检测方法在审
申请号: | 201910848366.7 | 申请日: | 2019-09-09 |
公开(公告)号: | CN110441438A | 公开(公告)日: | 2019-11-12 |
发明(设计)人: | 尚东;尹沛源;刘建均;项红;宋慧一 | 申请(专利权)人: | 大连医科大学附属第一医院 |
主分类号: | G01N30/02 | 分类号: | G01N30/02;G01N30/72;G16B50/30;G16H50/50 |
代理公司: | 大连东方专利代理有限责任公司 21212 | 代理人: | 周媛媛;李馨 |
地址: | 116011 辽*** | 国省代码: | 辽宁;21 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 急性胰腺炎 程度预测 检测 重症急性胰腺炎 检测技术领域 诊断 定量检测 假阳性率 预测模型 假阴性 灵敏度 影像学 主观性 量表 | ||
1.一种基于S100蛋白家族的急性胰腺炎严重程度预测模型,其特征在于,所述急性胰腺炎严重程度预测模型为Y=ex,其中X=-3.102+(-5.98E-04)*S100A11+(3.33E-06)*S100A12+(6.28E-05)*S100A6+(2.46E-05)*S100A8+(-2.54E-05)*S100A9+(1.22E-04)*S100P,所述S100A6,S100A8,S100S9,S100A11,S100A12,S100P分别为待检测样本血清中S100A6,S100A8,S100S9,S100A11,S100A12,S100P蛋白的浓度,当Y值>0.14489时,提示为高重症胰腺炎发病风险。
2.根据权利要求1所述的预测模型的检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
(1)采集血清,依次加入裂解缓冲液和Tris-HCl缓冲液,所述血清、裂解缓冲液和Tris-HCl缓冲液的体积比为1:20:5,恒温孵育;
(2)加入碘乙酰胺,避光恒温孵育;
(3)胰酶消化得到肽段,所得肽段加入10μL pH 2-3的三氟乙酸酸化后,以C18SPE柱除盐,然后将所得肽段冻干;
(4)步骤(3)得到的样品复溶于复溶溶剂,采用DIA定量蛋白质组学分析方法检测血清中S100A6,S100A8,S100S9,S100A11,S100A12,S100P蛋白的浓度,并通过模型Y=ex,其中X=-3.102+(-5.98E-04)*S100A11+(3.33E-06)*S100A12+(6.28E-05)*S100A6+(2.46E-05)*S100A8+(-2.54E-05)*S100A9+(1.22E-04)*S100P计算来进行急性胰腺炎严重程度的预测,当Y值>0.14489时,提示为高重症胰腺炎发病风险。
3.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中的裂解缓冲液为0.1M碳酸氢钠,6M尿素以及2M硫脲。
4.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中Tris-HCl缓冲液的PH值为8.5。
5.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(1)中孵育条件为33℃下恒温孵育45分钟。
6.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(2)中碘乙酰胺的浓度为40mM,碘乙酰胺与血清的体积比为1:4,孵育温度为25℃,孵育时间为1h。
7.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(3)中胰酶的用量为100μL,浓度为0.01ug/μL,胰酶消化条件为33℃下消化16h。
8.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)中的复溶溶剂为含有0.1%甲酸和2%乙腈的水溶液,所述复溶溶剂的体积为20μL。
9.根据权利要求2所述的检测方法,其特征在于,所述步骤(4)DIA定量蛋白质组学分析方法参数设置具体为:样品分离采用120分钟液相色谱梯度,其中,流动相:A:体积比为0.1%的甲酸/水;B:体积比为0.1%的甲酸/水/乙腈,其中甲酸:水:乙腈的体积比为0.1:19.9:80;梯度:0~6min,3%-8%B,6~108min,8%-30%B,108~116min,30%-90%B,116~120min,90%-90%B;流速:300nL/min,进样量为0.4μg;质谱质核比范围设定为400to1000m/z,一级质谱分辨率设定为60000,二级质谱分辨率设定为30000。
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