[发明专利]利用PCR-RFLP检测绵羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法及其应用有效

专利信息
申请号: 201910860404.0 申请日: 2019-09-11
公开(公告)号: CN110592190B 公开(公告)日: 2023-03-07
发明(设计)人: 乐祥鹏;罗静;秦芳;李发弟;李万宏 申请(专利权)人: 甘肃润牧生物工程有限责任公司
主分类号: C12Q1/683 分类号: C12Q1/683;G16B5/00
代理公司: 成都时誉知识产权代理事务所(普通合伙) 51250 代理人: 何悦
地址: 737200 甘肃省金昌市*** 国省代码: 甘肃;62
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摘要:
搜索关键词: 利用 pcr rflp 检测 绵羊 dazl 基因 核苷酸 多态性 方法 及其 应用
【权利要求书】:

1.利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于,所述方法包括利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因第26750位为G或A的单核苷酸多态性;所述应用为建立基因型为GG纯合型的湖羊群体,提高湖羊产羔率。

2.根据权利要求1所述的利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于,

所述的检测方法包括以下步骤:

S1采集屠宰湖羊的睾丸组织,经过液氮环境保存后,再经过研磨成粉,将得到的粉末取0.1g置于1000 μL DNA抽提缓冲液,并经过在55℃下的蛋白酶K处理,取反应后溶液经过Tris-饱和酚处理得到DNA提取液;

S2将所述的DNA提取液经过琼脂糖凝胶电泳检测,选择电泳结果中条带均一、无拖尾和无降解的DNA提取液,稀释至50 ng/μL;

S3采用混合加样法以特异性引物对P进行PCR扩增,得到多个DNA样品片段,将所述的多个DNA样品片段采用限制性内切酶AluI消化后,进行琼脂糖凝胶电泳,将得到的多个DNA样品小分子进行切胶回收及纯化,得到纯化DNA;所述的特异性引物对P为:

上游引物:5’- AGTTTGGAGTCTCAGGATTT -3’ 20nt,

下游引物:5’- GCATGATGTACTCTGTGTAG -3’ 20nt;

S4针对所述纯化DNA进行凝胶成像,判定其基因型,确定纯化DNA的基因型;将所述纯化DNA进行双向测序,判定绵羊DAZL基因第26750位的单核苷酸多态性。

3.根据权利要求2所述的利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于,

所述S2中稀释步骤前将选取的DNA提取液通过吸光度检测判定是否需要纯化处理。

4.根据权利要求3所述的利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于:所述的通过吸光度检测判定为:测定DNA提取液在260nm、280nm的紫外光下的OD值,计算DNA含量和OD260/OD280的比值;当OD260/OD280的比值小于1.6时,进行纯化处理;当OD260/OD280的比值大于1.8时,进行去除RNA的纯化。

5.根据权利要求2所述的利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于:计算DNA含量公式为:

DNA浓度ng/μL=50×OD260值×稀释倍数。

6.根据权利要求2所述利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于:所述的PCR扩增为:94℃预变性5min;94℃变性30 s,57℃退火30s,72℃延伸30s,34个循环;72℃延伸5 min。

7.根据权利要求2所述的利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于:所述的混合加样法为:根据每一个PCR反应体系所需的各种组分的数量和1次反应所需的所述PCR反应体系的个数,算出各种反应组分的总量,加入到1个1.5 mL或者2.0 mL离心管中,充分混匀后瞬时离心,再分装到每个0.2 mLEppendorf PCR管中,然后加入模板DNA,再瞬时离心后进行PCR扩增。

8.根据权利要求7所述的利用PCR-RFLP检测湖羊DAZL基因单核苷酸多态性的方法在湖羊分子育种中的应用,其特征在于:所述的PCR反应体系为:2.5μL的1×buffer缓冲液、0.5μL的10pmol/L的特异性引物对P、5.0μL的浓度为50ng/μL的品种DNA池和17.0μL的灭菌超纯水。

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