[发明专利]一种从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法在审

专利信息
申请号: 201910861066.2 申请日: 2019-09-12
公开(公告)号: CN110499378A 公开(公告)日: 2019-11-26
发明(设计)人: 李敬;王旭;孙宝林;郭建;吴谨 申请(专利权)人: 卓源健康科技有限公司
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/686;C12Q1/10;C12R1/19
代理公司: 34120 合肥顺超知识产权代理事务所(特殊普通合伙) 代理人: 张芳<国际申请>=<国际公布>=<进入国
地址: 230088 安徽省合肥市高新区望*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 大肠埃希菌 基因组DNA 检测 血液 临床血液 病原菌 大肠埃希菌感染 琼脂糖凝胶电泳 基因组DNA序列 反向引物 快速提取 扩增片段 特异基因 正向引物 快速PCR 扩增 引物 判定 诊断
【权利要求书】:

1.一种从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法,其特征在于,包括以下步骤:

S1、血液中大肠埃希菌基因组DNA的提取;

S2、血液中大肠埃希菌PCR检测:

S2.1、利用大肠埃希菌基因组DNA序列设计一段特异性的PCR引物,所述PCR引物包括正向引物和反向引物;

所述正向引物如SEQ ID NO.1所示:5’-TAATGTTCTGCGACGCTCAC-3’;

所述反向引物如SEQ ID NO.2所示:5’-CCCGGCTAACGTATCCAC-3’;

引物的扩增片段长度为200bp;

S2.2、以步骤S1中从血液中提取的大肠埃希菌基因组DNA为模板,采用步骤S2.1中的特异性的PCR引物进行PCR扩增;

S2.3、对PCR扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳及检测,扩增出长度为200bp的片段则判定为检测出大肠埃希菌。

2.根据权利要求1所述的从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1中,血液样品中大肠埃希菌基因组DNA的提取具体包括以下步骤:

S1.1、血液样品与酶裂解液等体积混合混匀,37℃孵育15分钟;

S1.2、步骤S1.1中酶裂解液处理的血液样品与碱裂解液等体积混合,轻轻混匀,室温静置裂解5分钟;

S1.3、步骤S1.2中裂解处理后的血液样品与去杂液体按积比为2:1混合,加入去杂液后立即混匀直至出现沉淀,放置离心机中室温12000转/分钟离心10分钟;

S1.4、轻轻吸取上层悬液至DNA吸附柱中,并将DNA吸附柱套在2mL离心管内;12000转/分钟离心1分钟,去除离心管内的废液,将2mL离心管重新套入DNA吸附柱;

S1.5、向DNA吸附柱内加入500μL的0.4M KI与异丙醇混合液;12000转/分钟离心1分钟,去除离心管内的废液,将2mL离心管重新套入DNA吸附柱;

S1.6、再向DNA吸附柱内加入700μL的80%v/v无水乙醇和10mM pH8.0的Tris-HCl混合液;12000转/分钟离心1分钟,去除离心管内的废液,将2mL离心管重新套入DNA吸附柱;

S1.7、重复步骤S1.6 1次;

S1.8、空DNA吸附柱12000转/分钟离心5分钟,并将DNA吸附柱转移至1.5mL离心管内;

S1.9、向空DNA吸附柱膜中央加入30μL 10mM Tris-HCl和1mM EDTA混合液,pH为8.0-8.5;12000转/分钟离心2分钟,收集洗脱下来的基因组DNA。

3.根据权利要求2所述的从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1.1中,酶裂解液中含有:0.1mg/mL核糖核酸酶A、1mg/mL蛋白酶K、0.05mg/mL广谱裂解酶、10mg/mL溶菌酶、25mM Tris-HCl、10mM EDTA,pH 8.0-8.5。

4.根据权利要求2所述的从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1.2中,碱裂解液中含有:0.2M NaOH,1%SDS,pH 12-14。

5.根据权利要求2所述的从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S1.3中,去杂液中含有:4M NH4Ac-HAc,pH 4.5-4.8。

6.根据权利要求1所述的从临床血液中检测大肠埃希菌病原菌的方法,其特征在于,步骤S2.2中,PCR扩增时PCR的反应体系为:10倍PCR buffer(plus Mg2+)1μL,dNTPs底物(2.5mMeach)0.8μL,2μmol/L的正向引物1μL,2μmol/L的反向引物1μL,EasyTaq DNA polymerase(Transgen Biology)0.5μL,基因组DNA模板1μL,双蒸水补足至10μL。

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