[发明专利]一种快速检测爪哇根结线虫的LAMP引物及其应用、检测方法在审
申请号: | 201910864455.0 | 申请日: | 2019-09-12 |
公开(公告)号: | CN110423748A | 公开(公告)日: | 2019-11-08 |
发明(设计)人: | 宋志强;梅时勇;杨喜爱;张晓伟;肖清明;肖爱平;冷娟 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院麻类研究所 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6888;C12Q1/6844 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 刘颖 |
地址: | 410000 湖南*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 爪哇根结线虫 快速检测 引物 应用 检测技术领域 现场快速检测 反向内引物 反向外引物 核苷酸序列 正向内引物 正向外引物 结果判定 科学用药 特异性强 土壤样品 仪器设备 早期诊断 植物病原 组织样品 可视化 灵敏度 植物根 检测 线虫 | ||
1.引物组合,其特征在于,包括正向外引物、反向外引物、正向内引物和反向内引物;
所述正向外引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示;
所述反向外引物的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示;
所述正向内引物的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示;
所述反向内引物的核苷酸序列如SEQ ID No.5所示。
2.如权利要求1所述的引物组合在检测爪哇根结线虫中的应用。
3.如权利要求2所述的应用,其特征在于,待测样品为线虫样品、植物根组织样品和/或土壤样品。
4.如权利要求1所述的引物组合在制备爪哇根结线虫检测试剂或试剂盒中的应用。
5.一种爪哇根结线虫的LAMP检测方法,其特征在于,包括以下步骤:
步骤1、提取待测样品的DNA;
步骤2、以所述待测样品的DNA为模板,利用如权利要求1所述的引物组合,建立LAMP反应体系,进行LAMP扩增;
步骤3、根据步骤2中LAMP扩增的反应结果判定所述待测样品中是否含有爪哇根结线虫;
所述判定标准为:
(1)向所述LAMP扩增的产物中加入显色剂,如果所述LAMP扩增的产物呈绿色,则检测结果为阳性,表明所述待测样品中含有爪哇根结线虫;如果所述LAMP扩增的产物呈橙色,则检测结果为阴性,表明所述待测样品中不含有爪哇根结线虫;或
(2)取所述LAMP扩增的产物于2%琼脂糖凝胶中电泳,在紫外光下进行检测,如果出现梯状条带,表明所述待测样品中含有爪哇根结线虫;如果未出现梯状条带,表明所述待测样品中不含有爪哇根结线虫。
6.如权利要求5所述的LAMP检测方法,其特征在于,所述LAMP反应体系为25μL,包括1μLDNA模板,0.2μmol/L正向外引物,0.2μmol/L反向外引物,1.6μmol/L正向内引物,1.6μmol/L反向内引物,1.2mmol/LdNTPs,6mmol/L MgSO4,20mmol/L Tris-HCl(pH 8.8),10mmol/LKCl,10mmol/L(NH4)2SO4,0.1%Triton X-100,8U Bst DNA聚合酶,余量用ddH2O补足。
7.如权利要求5或6所述的LAMP检测方法,其特征在于,所述显色剂包括体积比为1:9的SYBR green I与PCR级DMSO的混合物。
8.如权利要求5至7任一项所述的LAMP检测方法,其特征在于,所述显色剂的加入时机为:步骤2中所述建立LAMP反应体系之后、LAMP扩增之前,在PCR管内盖上加入1μL显色剂。
9.如权利要求5至8任一项所述的LAMP检测方法,其特征在于,所述LAMP扩增的反应条件为:60℃~65℃保温30~90min。
10.一种快速检测爪哇根结线虫的LAMP试剂盒,其特征在于,包括如权利要求1所述的引物组合。
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