[发明专利]一种山羊IGF2BP1基因插入/缺失标记的检测方法有效

专利信息
申请号: 201910878058.9 申请日: 2019-09-17
公开(公告)号: CN110468218B 公开(公告)日: 2022-09-02
发明(设计)人: 蓝贤勇;王真;白洋洋;宋晓越;潘传英;屈雷;陈宏;朱海鲸;董书伟;李陇平;史雷 申请(专利权)人: 西北农林科技大学
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 西安通大专利代理有限责任公司 61200 代理人: 范巍
地址: 712100 陕*** 国省代码: 陕西;61
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摘要:
搜索关键词: 一种 山羊 igf2bp1 基因 插入 缺失 标记 检测 方法
【权利要求书】:

1.一种检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失多态性的方法在辅助提高陕北白绒山羊产羔数育种中的应用,其特征在于:所述检测山羊IGF2BP1基因插入/缺失多态性的方法包括以下步骤:

以待测山羊基因组DNA为模板,利用PCR扩增包含山羊IGF2BP1基因内含子区插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1的片段和包含山羊IGF2BP1基因3' 调控区插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2的片段,对扩增产物进行电泳,根据电泳结果鉴定对应插入/缺失多态性位点的基因型;所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1为rs647937245,所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2为rs662236553;

根据电泳结果,所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1的插入/插入基因型表现为152bp一条带纹,所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1的插入/缺失基因型表现为152 bp和137 bp两条带纹,所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1的缺失/缺失基因型表现为137bp一条带纹;所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2的插入/插入基因型表现为96 bp一条带纹,所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2的插入/缺失基因型表现为96 bp和91 bp两条带纹,所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2的缺失/缺失基因型为91bp一条带纹;

所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1采用的PCR扩增引物对为:

上游引物:5'- TGTGATGCAGATACCGTGAA -3';

下游引物:5'- CGTGAACCTGATCTAAGGAGG -3' ;

所述插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2采用的PCR扩增引物对为:

上游引物:5'- CTGGATTTCACACGGGGTCT -3';

下游引物:5'- TCCTTTACCCTGAGCTCTCCA -3' ;

所述应用为选择插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P1和插入/缺失多态性位点IGF2BP1-P2的插入/插入基因型的陕北白绒山羊来提高山羊产羔数。

2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:所述PCR采用的反应程序为:95℃预变性5min;94℃变性30 s,68℃退火30 s,72℃延伸15 s,18个循环,每个循环后退火温度下降1℃;50℃退火30 s,72℃延伸15 s,32个循环;72℃延伸10 min;所述电泳采用质量浓度为3.5% 的琼脂糖凝胶。

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