[发明专利]一种与鸡背部毛孔密度相关的SNP分子标记及其应用有效
申请号: | 201910884732.4 | 申请日: | 2019-09-19 |
公开(公告)号: | CN110551828B | 公开(公告)日: | 2021-02-26 |
发明(设计)人: | 沈曼曼;王克华;曲亮;马猛;卢建;窦套存;胡玉萍;郭军;王星果;李永峰;李尚民 | 申请(专利权)人: | 江苏省家禽科学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/11 |
代理公司: | 焦作加贝专利代理事务所(普通合伙) 41182 | 代理人: | 任昕 |
地址: | 225125 江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 背部 毛孔 密度 相关 snp 分子 标记 及其 应用 | ||
1.检测一种SNP分子标记的试剂在制备用于鉴定待测鸡背部毛孔密度的试剂盒中的应用,其中,
所述鸡选自由东乡绿壳蛋鸡和白莱航蛋鸡构建的F2代资源群体母鸡,所述SNP分子标记的SNP位点位于国际鸡参考基因组GRCg6a PrimaryAssembly版本第1号染色体第169981107位,且该处碱基是G或A,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,且其第162位碱基是G或A。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述试剂为能够扩增所述SNP分子标记的引物组合。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,所述引物组合的核苷酸序列如SEQ IDNO.1和SEQ ID NO.2所示。
4.一种选育背部毛孔密度少的鸡种的方法,其特征在于,包括以下步骤:
(1)获取待测鸡的基因组DNA;
(2)检测所述基因组DNA中一种SNP分子标记的基因型,
选择AA基因型鸡,淘汰GG和GA基因型鸡,其中,
所述鸡选自由东乡绿壳蛋鸡和白莱航蛋鸡构建的F2代资源群体母鸡,所述SNP分子标记的SNP位点位于国际鸡参考基因组GRCg6a PrimaryAssembly版本第1号染色体第169981107位,且该处碱基是G或A,所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,且其第162位碱基是G或A,
所述背部毛孔密度少是指背部毛孔密度不大于参考值,所述参考值是指特定鸡种大量样本鸡背部毛孔密度的平均值或中位值。
5.根据权利要求4所述的方法,其特征在于,(2)中利用引物组合检测所述SNP分子标记的基因型。
6.根据权利要求5所述的方法,其特征在于,所述引物组合的核苷酸序列如SEQ IDNO.1和SEQ ID NO.2所示。
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