[发明专利]丙肝肝纤维化特征信息提取方法及装置有效
申请号: | 201910887661.3 | 申请日: | 2019-09-19 |
公开(公告)号: | CN110599485B | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 饶慧瑛;刘峰;魏来;任亚运;滕霄;戴其尚 | 申请(专利权)人: | 北京大学人民医院(北京大学第二临床医学院);杭州筹图科技有限公司 |
主分类号: | G06T7/00 | 分类号: | G06T7/00;G16H30/00;G16H50/20;G16H70/20 |
代理公司: | 北京集佳知识产权代理有限公司 11227 | 代理人: | 林哲生 |
地址: | 100044 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 丙肝 纤维化 特征 信息 提取 方法 装置 | ||
本发明公开了一种丙肝肝纤维化特征信息提取方法及装置,对目标样本的非染色切片利用SHG和TPE进行成像,得到目标图像,获取目标图像中的SHG参数,并对SHG参数进行量化,得到胶原蛋白的形态特征;通过将特定的临床特征和胶原蛋白的形态特征对患者的组织学反应进行预测,并选择与治疗前后Ishak分期变化满足预设条件的参数,生成二维热图。实现了利用二维热图,对持续病毒学反应后Ishak分期变化进行预测,获得ISHAK纤维化分期变化的预测性能。从而实现了使用光学技术预测治疗前病毒感染相关纤维化的纤维化逆转,使得其能够满足当前的临床需求,为后续的临床研究提供数据基础。
技术领域
本发明涉及医学信息处理技术领域,特别是涉及一种基于二次谐波和双光子激发荧光的丙肝肝纤维化特征信息提取方法及装置。
背景技术
二次谐波(SHG)和双光子激发荧光(TPE)显微镜定量评估未染色组织样本中的胶原。在慢性纤维疾病中,瘢痕进展和退行往往同时进行,虽然考虑到持续的慢性损伤,但是总的平衡有利于进展。由于这些疾病在治疗过程中较为困难,识别进展与回归和/或预后的胶原参数在很大程度上不容易获取。
然而,几乎所有的患者都能成功地根除丙型肝炎病毒,从而能够研究丙型肝炎的进展和逆转特征。此外,由于这种完全的病毒根除并不一定意味着纤维化的完全解决,因此需要新的特征信息来表征丙肝肝纤维化形态特征,以实现对治疗前病毒感染相关纤维化的纤维化逆转,以使能研究人员能够根据预测结果进行进一步的病理研究。
发明内容
针对于上述问题,本发明提供一种丙肝肝纤维化特征信息提取方法及装置,实现了能够获得表征丙肝肝纤维化特征信息的二维热图,从而对治疗前病毒感染相关纤维化的纤维化逆转的预测。
为了实现上述目的,本发明提供了如下技术方案:
一种丙肝肝纤维化特征信息提取方法,该方法包括:
获取目标样本,所述目标样本是根据丙型肝炎肝活检标本生成的;
通过SHG和TPE对所述目标样本对应的非染色切片进行成像,得到目标图像;
获取所述目标图像中的SHG参数,并对所述SHG参数进行量化,得到胶原蛋白的形态特征;
通过将特定的临床特征和所述胶原蛋白的形态特征对患者的组织学反应进行预测,并选择与治疗前后Ishak分期变化满足预设条件的参数,生成二维热图,所述二维热图表征丙肝肝纤维化特征信息,使得能够利用所述二维热图,对持续病毒学反应后Ishak分期变化进行预测,获得ISHAK纤维化分期变化的预测性能。
可选地,所述获取目标样本,包括:
依据特征提取条件,在丙型肝炎肝活检标本中选取初始样本;
对所述初始样本进行预处理和分组,获得目标样本,所述预处理包括固定、包埋和切片,所述目标样本包括有效样本和无效样本。
可选地,该方法还包括:
在对所述SHG参数进行量化时,对胶原进行分组,其中,按照模式分组时,所述胶原分为分散的胶原和聚集的胶原;按照胶原位置分组,所述胶原分为门静脉胶原、间隔胶原和纤维胶原。
可选地,该方法还包括:
采用秩和检验,对治疗前有效样本和无效样本患者临床参数和SHG参数的统计差异进行评估,获得评估结果,所述评估结果用于胶原蛋白的形态特征进行选择。
可选地,所述利用所述二维热图,对持续病毒学反应后Ishak分期变化进行预测,获得ISHAK纤维化分期变化的预测性能,包括:
分别构建热图的训练集和测试集,所述训练集对热图进行训练,所述测试集用于对热图;
根据所述训练集和测试集来确定目标热图;
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