[发明专利]一种与猪肉pH值性状相关的分子标记及应用有效
申请号: | 201910900804.X | 申请日: | 2019-09-23 |
公开(公告)号: | CN110592232B | 公开(公告)日: | 2022-04-26 |
发明(设计)人: | 甘麦邻;朱砺;沈林園;张顺华;范源;刘麟;陈映;牛丽莉;赵叶;廖坤 | 申请(专利权)人: | 四川农业大学 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12N15/113 |
代理公司: | 北京风雅颂专利代理有限公司 11403 | 代理人: | 张拥 |
地址: | 625099 四*** | 国省代码: | 四川;51 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 猪肉 ph 性状 相关 分子 标记 应用 | ||
1.检测分子标记表达量的试剂在预测猪肉pH值性状中的应用,其特征在
于,所述分子标记为ssc-miR-152,所述ssc-miR-152的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述ssc-miR-152的表达量与猪肉pH值正相关;
所述ssc-miR-152可通过结合PKM基因的特定序列抑制PKM基因的表达,所述PKM基因与所述ssc-miR-152的结合位点为(1)~(4)中的至少一种:
(1)位于PKM 3'UTR区460bp-474bp处,序列为:5'-TCCCCCTTTGTTGTGCACTGT-3';
(2)位于PKM CDS区1318bp-1326bp处,序列为:5'-CAGCTGAAGTTC ATGCACACC-3';
(3)位于PKM 5'UTR区399bp-413bp处,序列为:5'-AGGGGTGCTGCCTAGCACTGA-3';
(4)位于PKM CDS区1091bp-1097bp处,序列为:5'-TTCTGTGGTGGAC CCCACTGA-3';
其中,所述PKM为肌肉型丙酮酸激酶。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于,所述PKM基因的cDNA序列如SEQ ID NO:2所示。
3.根据权利要求2所述的应用,其特征在于,扩增PKM基因的引物对为:
PKM的上游引物:5'-CCTGATAGCTCGTGAGGCTG-3';
PKM的下游引物:5'-AGGTCTGTGGAGTGACTGGA-3'。
4.检测分子标记表达量的试剂在猪肉pH值性状遗传改良中的应用,其特征在于,所述分子标记为ssc-miR-152,所述ssc-miR-152的核苷酸序列如SEQ ID NO:1所示;所述ssc-miR-152的表达量与猪肉pH值正相关;
所述ssc-miR-152可通过结合PKM基因的特定序列抑制PKM基因的表达,所述PKM基因与所述ssc-miR-152的结合位点为(1)~(4)中的至少一种:
(1)位于PKM 3'UTR区460bp-474bp处,序列为:5'-TCCCCCTTTGTTGTGCACTGT-3';
(2)位于PKM CDS区1318bp-1326bp处,序列为:5'-CAGCTGAAGTTC ATGCACACC-3';
(3)位于PKM 5'UTR区399bp-413bp处,序列为:5'-AGGGGTGCTGCCTAGCACTGA-3';
(4)位于PKM CDS区1091bp-1097bp处,序列为:5'-TTCTGTGGTGGAC CCCACTGA-3';
其中,所述PKM为肌肉型丙酮酸激酶。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述PKM基因的cDNA序列如SEQ ID NO:2所示。
6.根据权利要求5所述的应用,其特征在于,扩增PKM基因的引物对为:
PKM的上游引物:5'-CCTGATAGCTCGTGAGGCTG-3';
PKM的下游引物:5'-AGGTCTGTGGAGTGACTGGA-3'。
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