[发明专利]核酸片段的分子量校正方法及装置有效
申请号: | 201910910351.9 | 申请日: | 2019-09-25 |
公开(公告)号: | CN110596224B | 公开(公告)日: | 2022-04-15 |
发明(设计)人: | 张吉华;吕华 | 申请(专利权)人: | 南京溯远基因科技有限公司 |
主分类号: | G01N27/447 | 分类号: | G01N27/447 |
代理公司: | 北京超凡宏宇专利代理事务所(特殊普通合伙) 11463 | 代理人: | 李莎 |
地址: | 210000 江苏省南京市浦口区江*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 核酸 片段 分子量 校正 方法 装置 | ||
1.一种核酸片段的分子量校正方法,其特征在于,所述方法包括:
从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰,并获得每个所述第一信号峰的峰位;
根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位,从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰,其中,所述核酸片段分子量标准物中包括多个标记片段的分子量;
根据所述第二信号峰和与所述第二信号峰对应的标记片段的分子量对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段进行处理得到分子量校正模型;
根据分子量校正模型对待校正核酸片段的分子量进行校正;
其中,根据所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的分子量之间的间隔和每个所述第一信号峰的峰位,从查找到的第一信号峰中确定与每个所述标记片段的分子量对应的第二信号峰的步骤,包括:
获得电泳信号中查找到的所有第一信号峰中最后两个第一信号峰的峰位帧数,并计算所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔;
计算核酸片段分子量标准物中最后两个标记片段的分子量间隔;
将所述最后两个第一信号峰的峰位帧数之间的间隔除以所述最后两个标记片段的分子量间隔,得到单位分子量对应的电泳信号帧数;
根据所述电泳信号帧数以及所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量之间的间隔,依次查找出与所述核酸片段分子量标准物中各标记片段分子量对应的第二信号峰;
得到所述分子量校正模型的步骤包括:
获得每个标记片段的分子量、核酸片段分子的净电荷、电泳凝胶的粘度、毛细管电泳电压、毛细管长度以及分子量相关的关系系数与电泳的迁移速率之间的第一预设关系,其中,所述第一预设关系满足,为所述电泳的迁移速率,,为所述核酸片段分子的净电荷,为所述毛细管的电泳电压,为所述电泳凝胶的粘度,为所述毛细管长度,为核酸片段分子量,和是与分子量相关的关系系数;
获得所述毛细管的集束端到检测窗口之间的距离和该检测窗口处采集毛细管电泳的采集帧数之间的第二预设关系,其中,所述第二预设关系为,为所述距离,为所述采集帧数;
基于所述第一预设关系和所述第二预设关系得到毛细管电泳采集帧数与分子量标准物标记片段的分子量之间的对应关系,其中,该对应关系为,为常数;
对所述核酸片段分子量标准物中各标记片段的电泳采集帧数和对应的分子量按照所述对应关系进行拟合得到分子量校正模型。
2.根据权利要求1所述的核酸片段的分子量校正方法,其特征在于,从核酸片段分子量标准物的电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰的步骤包括:
从核酸片段分子量标准物的毛细管电泳信号中查找信号峰峰值大于一预设值的第一信号峰。
3.根据权利要求1所述的核酸片段的分子量校正方法,其特征在于,所述核酸片段分子量标准物中标记片段为100bp-1000bp之间。
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