[发明专利]SSR分子标记引物、仙草品种的鉴定方法及试剂盒有效
申请号: | 201910926128.3 | 申请日: | 2019-09-27 |
公开(公告)号: | CN110484653B | 公开(公告)日: | 2023-05-19 |
发明(设计)人: | 张南南;齐永文;高小宁;吴自林;曾巧英;郑召 | 申请(专利权)人: | 广东省科学院南繁种业研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/686;C12N15/11 |
代理公司: | 华进联合专利商标代理有限公司 44224 | 代理人: | 方宇 |
地址: | 510300 广*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | ssr 分子 标记 引物 仙草 品种 鉴定 方法 试剂盒 | ||
本发明涉及一种SSR分子标记引物、仙草品种的鉴定方法及试剂盒。该SSR分子标记引物用于扩增分子标记,仙草的分子标记选自SSR80位点、SSR82位点、SSR83位点、SSR100位点、SSR102位点及SSR106位点中的至少一种。通过上述SSR分子标记引物能够快速、准确地确定仙草的品种。
技术领域
本发明涉及分子生物技术领域,特别是涉及一种SSR分子标记引物、仙草品种的鉴定方法及试剂盒。
背景技术
仙草(Mesona chinensis Benth)又名仙人草、凉粉草,为唇形科凉粉草属一年生草本宿根植物,是我国南方和东南亚国家的重要保健食品,国内主要产地包括台湾、浙江、江西、广东、福建和广西西部。仙草味甘微涩,性寒凉,自古以来被用作消暑解渴、凉血之良药。现代药理学研究表明,仙草具有抗氧化、降血压、降血糖、降血脂、抗菌等多种功效。仙草主要用于凉茶和仙人冻的加工生产,但两种用途对仙草的原料要求不同。
不同仙草品种中多糖的含量相差很大,这些差异直接影响仙草的食用品质和生产用途,因此仙草品种鉴定和纯度鉴定工作非常重要。人们早期采用形态学特征作为仙草品种鉴定依据。然而这种鉴定方法依赖于鉴定人员的长期经验积累,容易受环境和主观因素的影响,费时费力且准确度无法保证。因此建立一套快速、精准、经济的仙草品种鉴定技术,对于仙草产业的发展非常重要。
发明内容
基于此,针对目前仙草品种鉴定时的费时费力且准确度无法保证的问题,有必要提供一种能够快速、精准鉴定仙草品种的SSR分子标记引物、仙草品种的鉴定方法及试剂盒。
一种SSR分子标记引物,用于扩增仙草中含有SSR分子标记的核苷酸片段所述SSR分子标记包括SSR80位点、SSR82位点、SSR83位点、SSR100位点、SSR102位点及SSR106位点中的至少一种,所述SSR80位点的核苷酸序列包含以ACACG为重复单元的串联重复序列,所述SSR82位点的核苷酸序列包含以AGATA为重复单元的串联重复序列,所述SSR83位点的核苷酸序列包含以ATAAA为重复单元的串联重复序列,所述SSR100位点的核苷酸序列包含以AATCT为重复单元的串联重复序列,所述SSR102位点的核苷酸序列包含以TTTAT为重复单元的串联重复序列,所述SSR106位点的核苷酸序列包含以TCCACA为重复单元的串联重复序列。
上述SSR分子标记引物能够快速、准确地确定仙草的品种。
在其中一个实施例中,所述SSR80位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示,所述SSR82位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.2所示,所述SSR83位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.3所示,所述SSR100位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.4所示,所述SSR102位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.5所示,所述SSR106位点的核苷酸序列如SEQ ID NO.6所示。
在其中一个实施例中,包括用于扩增含有SSR80位点的核苷酸片段、含有SSR82位点的核苷酸片段、含有SSR100位点的核苷酸片段及含有SSR106位点的核苷酸片段的引物中的至少一种。
在其中一个实施例中,用于扩增含有所述SSR80位点的核苷酸片段的引物的序列分别如SEQ ID NO.7~SEQ ID NO.8所示;用于扩增含有所述SSR82位点的核苷酸片段的引物的序列分别如SEQ ID NO.9~SEQ ID NO.10所示;用于扩增含有所述SSR83位点的核苷酸片段的引物的序列分别如SEQ ID NO.11~SEQ ID NO.12所示;用于扩增含有所述SSR100位点的核苷酸片段的引物的序列分别如SEQ ID NO.13~SEQ ID NO.14所示;用于扩增含有所述SSR102位点的核苷酸片段的引物的序列分别如SEQ ID NO.15~SEQ ID NO.16所示;用于扩增含有所述SSR106位点的核苷酸片段的引物的序列分别如SEQ ID NO.17~SEQ IDNO.18所示。
一种仙草品种的鉴定方法,包括以下步骤:
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