[发明专利]小麦成株期抗条锈病基因相关SNP分子标记及其引物和应用

说明书

本发明属于农业生物技术领域，具体涉及小麦成株期抗条锈病基因相关SNP分子标记及其特异性引物和应用。小麦成株期抗条锈病基因相关SNP分子标记，其核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中，SEQ ID NO.1所示序列的第36位碱基为A或G。本发明的分子标记可用于小麦抗条锈病的辅助选择育种，可克服常规育种中小麦条锈病抗性鉴定易受环境影响、稳定性和重复性较差、工作量大、费时费力、育种周期长等缺点，进而加快小麦抗条锈病品种的育种进程。

技术领域

本发明属于农业生物技术领域，具体涉及小麦成株期抗条锈病基因相关SNP分子标记及其特异性引物和应用。

背景技术

小麦作为我国重要的粮食作物，其质量和产量直接关系到国家粮食安全问题。由条型柄锈菌(Puccinia striiformis Westend.f.sp.tritici，Pst)可随高空气流远距离传播，由其引起的小麦条锈病是对小麦危害程度最重的典型气传病害之一，具有暴发性强、流行速度快、危害程度重的特点。中国是世界上小麦条锈病发生面积最大且相对独立的小麦条锈病流行区，常年主要发生地有四川、贵州、甘肃、陕西、云南、宁夏、河南、山西等地。一般流行年份可使小麦减产20％～30％，严重时高达50％以上，甚至绝收，严重影响了我国小麦的生产。

我国小麦条锈病抗病育种面临着严峻局面，一方面条锈菌变异速度快、强毒性生理小种流行范围不断扩大且主栽品种或骨干亲本完全丧失抗性；另一方面，目前的主栽品种抗性遗传基础狭隘、可利用的条锈病抗性基因有限。这一现状已经构成小麦抗条锈病育种的瓶颈。我国在小麦条锈病防治方面也采取过许多防治策略，大多采用药剂拌种和抗锈良种相结合的方法。虽然传统的药剂防治可以从一定程度上减轻条锈病的危害，但是大量使用农药不仅增加了生产成本，还会对生态环境和人类健康产生很大的威胁。因此，发掘和鉴定抗条锈病新基因才是育种工作的基础，也是解决条锈病抗性基因丢失这一难题的根本途径。

随着分子生物学和生物技术的快速发展，分子标记技术在育种中的应用越来越广泛。DNA分子标记技术具有不受环境和植物生长发育影响的特点，结合传统田间抗病鉴定可在育种早期对植株的抗病性能进行综合分析，快速有效地进行育种选择，从而缩短育种进程，提高育种效率。目前主要在植物育种中应用的有RAPD、RFLP、AFLP、SSR、SNP等分子标记技术。SNP，即单核苷酸多态性(Single nucleotide polymorphism)，是指基因组内单个碱基的插入、转换、颠换、缺失或小片段序列的突变等，能直接反应DNA水平遗传的多态性。它的变异来源丰富，分布于整个基因组内，是继第一代分子标记RFLP，第二代分子标记SSR后的第三代分子标记，其建立在基因组大量测序或芯片的基础上。

目前SNP的检测方法很多，比如：DNA芯片检测、DNA测序法、变性高效液相色谱法、飞行质谱仪检测等，但大多由于技术繁琐、试验成本高，限制了其在植物育种中的应用。为了更加广泛地检测SNP标记，衍生酶切扩增多态性(derived cleaved amplifiedpolymorphic sequence，dCAPs)技术随之兴起，dCAPs技术通过特殊的引物，在PCR扩增产物中引入错配碱基，构建限制性内切酶识别位点，从而达到酶切检测SNP的目的。

发明内容

本发明的目的在于提供小麦成株期抗条锈病基因相关SNP分子标记。

本发明的再一目的在于提供上述分子标记的特异性SNP-dCAPs引物。

本发明的再一目的在于提供上述分子标记的应用。

本发明的再一目的在于提供鉴定小麦条锈病抗性的方法。

根据本发明具体实施方式的小麦成株期抗条锈病基因相关SNP分子标记，所述SNP分子标记的核苷酸序列如SEQ ID NO.1所示，其中，SEQ ID NO.1所示序列的第36位碱基为W，W代表A或G，

SEQ ID NO.1: