[发明专利]不同地区玉米粗缩病病原物的遗传变异分析方法在审
| 申请号： | 201910936016.6 | 申请日： | 2019-09-29 |
| 公开（公告）号： | CN110747291A | 公开（公告）日： | 2020-02-04 |
| 发明（设计）人： | 铁双贵;岳润清;赵志杰;刘璐;陈娜;徐心志;卢董华 | 申请（专利权）人： | 河南省农业科学院 |
| 主分类号： | C12Q1/70 | 分类号： | C12Q1/70;C12Q1/6869;C12R1/94 |
| 代理公司： | 41123 河南科技通律师事务所 | 代理人： | 樊羿;张晓辉 |
| 地址： | 450002 河*** | 国省代码： | 河南;41 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 遗传变异分析 可信 总RNA为模板 玉米粗缩病 叶片总RNA 比对分析 分析比对 碱基突变 样本提取 遗传变异 病原物 反转录 同源性 氨基酸 测序 侵染 叶片 病害 样本 病毒 回收 研究 | ||
【权利要求书】：
1.一种不同地区玉米粗缩病病原物的遗传变异分析方法，其特征在于，包括以下步骤：
（1）取待测玉米粗缩病染病植物的叶片样本，分别提取叶片总RNA；
（2）以所述总RNA为模板，分别利用核苷酸序列如SEQ ID NO.2的引物进行反转录，得cDNA；
（3）以所述cDNA为模板，分别利用核苷酸序列如SEQ ID NO.1的引物和核苷酸序列如SEQ ID NO.2的引物进行RT-PCR；
（4）将各RT-PCR扩增产物纯化回收后测序，分析比对出可信序列；
（5）将各可信序列与RBSDV的S9序列进行比对分析样本的同源性、碱基突变、氨基酸的改变情况。
2.依据权利要求1所述的不同地区玉米粗缩病病原物的遗传变异分析方法，其特征在于，在所述步骤（3）中，RT-PCR的反应程序为：
94℃ 5min；94℃ 1min；60℃ 1min；72℃ 70s 35个循环；72℃10min；4℃保存。
3.根据权利要求1所述的不同地区玉米粗缩病病原物的遗传变异分析方法，其特征在于，在所述步骤（4）中，采用 Clustal W 2.1分析比对可信序列。
4.根据权利要求1所述的不同地区玉米粗缩病病原物的遗传变异分析方法，其特征在于，在所述步骤（5）中，采用DNA man或Clustal W 2.1比对分析。
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